Masaki Tsujimura 研究室
主宰者:Masaki Tsujimura
東京大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、タンパク質内の水素結合とプロトン移動の仕組みを原子レベルで解明することを目標としています。特に、光受容タンパク質(ロドプシンなど)や G タンパク質共役受容体といった生命現象に重要な役割を果たすタンパク質を対象にしており、これらの分子がどのようにして光エネルギーを認識し、細胞内シグナルに変換するのかを研究しています。
研究には、量子化学と分子動力学シミュレーションを組み合わせた計算手法を採用しています。この手法により、タンパク質内の各原子の動きや、プロトンがどのように移動するのか、さらには水素結合がその強さや形態によってどのように変化するのかを詳細に追跡することが可能です。実験的には、結晶構造解析に基づいて理論計算を進めており、実測データとシミュレーション結果の統合を通じて信頼性の高い知見を得ています。
これまでの研究から、タンパク質環境内での水素結合の振動数やプロトン化状態が、吸収波長やリガンド結合特性に大きく影響することが明らかになっています。また、膜タンパク質内の水分子やイオンのネットワークが光誘起反応の制御に重要な役割を担っていることも示されています。こうした知見は、光応答性分子やシグナル伝達タンパク質の機能設計にも応用できる基礎知識として位置付けられます。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果(15 件)
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- [2023] pH-Dependent Binding and Releasing Mechanism of Acetate in the Inner Water Cavity of HeliorhodopsinDOI: https://doi.org/10.1021/acs.biochem.3c00193
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.2c07232
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2022.104247
- DOI: https://doi.org/10.1038/s42003-022-04311-x
- DOI: https://doi.org/10.3389/fmolb.2021.794948
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- DOI: https://doi.org/10.3389/fmolb.2021.794948
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2021.100459
- DOI: https://doi.org/10.2139/ssrn.3908775
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2021.100459
- DOI: https://doi.org/10.2139/ssrn.3908775
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