Koji Kadota 研究室
主宰者:Koji Kadota
東京大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、次世代シーケンシング技術によって得られる大規模な生物学的データの解析方法の開発と教育に取り組んでいます。特に遺伝子発現データの解析に力を入れており、異なる条件下で発現量が変動する遺伝子を検出するためのアルゴリズムやプログラムの改善を続けています。クラスタリング手法を応用した複数の解析ツールを開発し、従来の手法との性能比較を通じて、各手法がどのような条件で有効であるかを明らかにする研究を行っています。
また、微生物群集の塩基配列情報を網羅的に解析するメタゲノム解析についても、解析の流れや統計的な基礎を教育する活動に力を入れています。DNA抽出から系統同定までのプロセスを、プログラミング言語Rを用いて段階的に解説することで、生物学と情報解析の両面から学習できる環境を整備しています。
一方、物質的なアプローチとしては、ペプチド化学の領域において、新規な側鎖を持つ短いペプチドを化学合成し、細胞膜への透過性や細胞内への取り込み効率を評価する研究も行っています。これらの取り組みを通じて、計算的手法と実験的手法の両面から生物現象の解明を目指しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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関連研究室(8 件)
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研究成果(25 件)
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- [2021] Methods for analyzing next-generation sequencing data XVII. The Future of Bioinformatics Education.DOI: https://doi.org/10.4109/jslab.32.129
- [2021] Differential expression analysis using a model-based gene clustering algorithm for RNA-seq dataDOI: https://doi.org/10.1186/s12859-021-04438-4
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