Martin C. Frith 研究室
主宰者:Martin C. Frith
東京大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
Frith研究室は、ゲノム(生物の遺伝情報全体)に含まれる様々な配列を効率よく検出・解析する方法の開発を行っています。特に、時間とともに変化した古い遺伝配列を見つけ出すことに力を注いでいます。研究対象には、ウイルス由来のDNA、転移因子(ゲノム内を移動する遺伝要素)、細胞の核に取り込まれたミトコンドリアDNA、さらには進化の過程で機能を失った「タンパク質の化石」などが含まれます。
解析手法としては、配列比較の確率論的な改善や、複数の配列アライメント(配列の並べ方)の可能性を同時に考慮する独自のアプローチを開発しています。また、ナノポア長鎖読み取り技術など最新のDNA読み取り技術を活用して、ゲノムの構造的な変異や遺伝子発現の異常を検出しています。
主な発見として、ヒトゲノムに隠れていた古い内在性レトロウイルスの新種を特定したほか、胎児期から成人期にかけての脳の遺伝子制御領域の変化や、筋肉病などの疾患に関連する遺伝配列の多様性を明らかにしています。さらに、動物界全体で進化的に保存されている発生制御領域を発見するなど、ゲノムの奥深い構造と進化の謎を解き明かす研究を展開しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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関連研究室(8 件)
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- 医学Nobuyuki Kakiuchi 研究室京都大学論文 100 件·共通: 進化, 進化・系統, 生態・進化, ゲノム +9
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- 保健専門職Takao Suzuki 研究室東京大学論文 127 件·共通: 生態・進化, ゲノム, 微生物, 純粋数学 +8
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研究成果(26 件)
- DOI: https://doi.org/10.1177/15578666261416560
- DOI: https://doi.org/10.1177/15578666261428480
- DOI: https://doi.org/10.1186/s13100-025-00348-x
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.xgen.2025.101010
- [2024] The Statistics of Parametrized Syncmers in a Simple Mutation Process Without Spurious MatchesDOI: https://doi.org/10.1089/cmb.2024.0508
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-024-75749-8
- [2024] A simple method for finding related sequences by adding probabilities of alternative alignmentsDOI: https://doi.org/10.1101/gr.279464.124
- DOI: https://doi.org/10.1093/bioadv/vbae110
- [2023] DNA Conserved in Diverse Animals Since the Precambrian Controls Genes for Embryonic DevelopmentDOI: https://doi.org/10.1093/molbev/msad275
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jmoldx.2023.10.004
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- DOI: https://doi.org/10.1016/j.xpro.2022.102027
- DOI: https://doi.org/10.1007/978-1-0716-2996-3_11
- DOI: https://doi.org/10.1093/bioadv/vbad013
- DOI: https://doi.org/10.1002/ctm2.1226
- DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btad057
- [2023] Biallelic structural variations within<i>FGF12</i>detected by long-read sequencing in epilepsyDOI: https://doi.org/10.26508/lsa.202302025
- [2022] Paleozoic Protein Fossils Illuminate the Evolution of Vertebrate Genomes and Transposable ElementsDOI: https://doi.org/10.1093/molbev/msac068
- DOI: https://doi.org/10.1007/978-1-0716-2996-3_12
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.06.032
- DOI: https://doi.org/10.1109/tcbb.2022.3177855
- DOI: https://doi.org/10.1038/s10038-020-00893-8
- DOI: https://doi.org/10.2139/ssrn.3933296
- DOI: https://doi.org/10.1186/s12920-020-00853-3
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-23143-7
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkab139
- [2021] Nanopore direct RNA sequencing detects DUX4-activated repeats and isoforms in human muscle cellsDOI: https://doi.org/10.1093/hmg/ddab063
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