Giovanni B. Brandani 研究室
主宰者:Giovanni B. Brandani
京都大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
Brandani研究室は、遺伝子発現や細胞機能を支える染色体構造の形成メカニズムを、計算機シミュレーションを用いて解明する研究を行っています。具体的には、DNA折り畳み複合体であるSMC(構造維持タンパク質)やコヒーシンなどの環状モータータンパク質が、ATP消費を駆動力としてDNAを掴み、どのようにして段階的にDNAを移動・ループ構造を形成するのかを、原子レベルおよび粗粒化された構造モデルによるシミュレーションで調べています。
加えて、核内でのクロマチン構造と遺伝子制御の関係性も対象としており、多様な実験データ(顕微鏡観察、ゲノム相互作用頻度など)を統合することで、エンハンサーとプロモーターの立体的配置と転写活性化の結びつきを理論的に予測しています。一方、膜タンパク質系では、シナプス後部密度を構成するタンパク質の相分離現象を研究し、細胞膜の幾何学的性質がいかに分子相互作用を制御するかを明らかにしています。このように同研究室は、マルチスケール・シミュレーションと実験データ融合により、生命現象を支える分子レベルの仕組みを物理的に解き明かす研究を展開しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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関連研究室(8 件)
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研究成果(14 件)
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- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkaf189
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- DOI: https://doi.org/10.7554/elife.106602.3
- DOI: https://doi.org/10.7554/elife.106602
- DOI: https://doi.org/10.1007/978-1-0716-4136-1_19
- DOI: https://doi.org/10.1063/5.0211222
- DOI: https://doi.org/10.1093/pnasnexus/pgae226
- [2024] Combining contact frequency and histone modification data to tune a coarse-grained chromatin modelDOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2023.11.2234
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- DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.2312022120
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkad738
- DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009253
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkab664
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