Kentaro K. Shimizu 研究室
主宰者：Kentaro K. Shimizu
横浜市立大学
AI 要約（直近 5 年の研究成果）
清水研究室は、植物の遺伝的多様性と形質の関係を、ゲノム解析と統計的手法を組み合わせて調査しています。特に、コムギやオオアラビドプシスなどのモデル植物および農作物を対象に、複数のゲノムセットを持つ多倍体植物における遺伝子発現の制御メカニズムを研究しています。RNA-seqデータを活用して、異なる組織や環境条件下での遺伝子発現パターンの変化を追跡し、どのゲノムセットがどのように機能しているかを明らかにしています。
さらに、圃場における隣接する植物の遺伝的背景が病虫害抵抗性に与える影響を調べる「Neighbor GWAS」という新しい解析手法を開発し、応用しています。この手法により、複数の遺伝型を混植した際に有益な組み合わせを予測できるようになり、より持続可能な農業生産への貢献を目指しています。
加えて、言語の構造的特徴と人間集団の遺伝的多様性の関係を調査する研究も進めており、集団の隔離や接触が両者に及ぼす並行的な影響を定量的に分析しています。これらの研究を通じて、生物多様性の維持と食糧安全保障の両立に向けた基礎知見を提供することを目指しています。
※ AI（Claude）が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果（66 件）
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- DOI: https://doi.org/10.5194/wbf2026-352
- DOI: https://doi.org/10.64096/0002001097
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2025.116785
- DOI: https://doi.org/10.64898/2026.05.22.727104
- DOI: https://doi.org/10.5167/uzh-433972
- DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.25267621231of10
- DOI: https://doi.org/10.1007/s12185-025-04049-2
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.idcr.2025.e02390
- DOI: https://doi.org/10.1093/pcp/pcaf011
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- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-025-08241-6
- DOI: https://doi.org/10.1007/s00122-025-04886-z
- [2025] Cartwheel aerenchyma in Cardamine amara as a model of schizogenous tissue formation in plantsDOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2025.113106
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkaf154
- DOI: https://doi.org/10.5167/uzh-291186
- DOI: https://doi.org/10.1093/insilicoplants/diaf023
- DOI: https://doi.org/10.1111/nph.70648
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-025-64046-1
- DOI: https://doi.org/10.1126/sciadv.adv7521
- DOI: https://doi.org/10.1186/s40337-024-01011-1
- DOI: https://doi.org/10.1016/s0168-8278(24)01536-8
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-024-52374-7
- [2024] Featured CoverDOI: https://doi.org/10.1111/apt.18168
- DOI: https://doi.org/10.1111/apt.18063
- DOI: https://doi.org/10.1097/md.0000000000036217
- DOI: https://doi.org/10.1093/evolut/qpad028
- DOI: https://doi.org/10.1007/s11692-023-09612-5
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.mex.2023.102518
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-023-43275-2
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- DOI: https://doi.org/10.1093/pcp/pcad113
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-023-41260-3
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- DOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.7402763
- DOI: https://doi.org/10.4109/jslab.34.21
- DOI: https://doi.org/10.1111/1440-1703.12382
- DOI: https://doi.org/10.3389/fpls.2022.1058522
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- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms23115959
- DOI: https://doi.org/10.1093/bbb/zbac064
- DOI: https://doi.org/10.3389/fnut.2021.791392
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- DOI: https://doi.org/10.3389/fpls.2021.768584
- DOI: https://doi.org/10.1270/jsbbs.21059
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.ecoinf.2021.101466
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-021-99641-x
- DOI: https://doi.org/10.1038/s42003-021-02682-1
- DOI: https://doi.org/10.3389/fpls.2021.715985
- [2021] Exploring correlations in genetic and cultural variation across language families in northeast AsiaDOI: https://doi.org/10.1126/sciadv.abd9223
- DOI: https://doi.org/10.1093/gbe/evab192
- DOI: https://doi.org/10.3389/fpls.2021.715309
- DOI: https://doi.org/10.1186/s12864-021-07845-2
- DOI: https://doi.org/10.1093/gbe/evab159
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41437-020-00401-w
- DOI: https://doi.org/10.5167/uzh-199111
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