Toru Ekimoto 研究室
主宰者：Toru Ekimoto
横浜市立大学・Yokohama City University Medical Center
AI 要約（直近 5 年の研究成果）
Ekimoto研究室は、タンパク質と脂質分子の相互作用および構造変化のメカニズムを原子レベルで解明する研究を進めています。主な対象は、ウイルス感染やホルモン応答に関わる膜貫通タンパク質や細胞表面受容体です。例えば、B型肝炎ウイルスが肝細胞に侵入する際に利用する受容体がどのように機能するか、また免疫応答に関連する受容体がリガンド分子を認識してシグナルを送る仕組みなどを調べています。
研究手法としては、電子顕微鏡による高精度の構造解析と分子動力学シミュレーションを組み合わせた計算解析を活用しています。これらのアプローチにより、結晶構造には見られない動的な構造変化や、複数の結合経路を時間軸を含めて捉えることが可能です。また、最近は深層学習を用いた構造予測の改善にも取り組み、膜環境の影響を陽に組み込む新しい手法を開発しています。
得られた主要な知見としては、タンパク質の機能は静的な構造では説明できず、複数のサイト間での協調的な結合、局所的な構造変化、および周辺分子環境が重要な役割を果たすということです。こうした発見は、ウイルス感染の制御やより効果的な医療品開発への応用可能性を示唆しています。
※ AI（Claude）が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
外部リンク
関連研究室(8 件)
- 生化学・分子生物学・遺伝学Miki Nagao 研究室京都大学論文 100 件·共通: ウイルス感染, ウイルス, 感染症, 微生物 +9
- 環境科学Akira Mori 研究室東京大学論文 187 件·共通: ウイルス感染, ウイルス, 感染症, 微生物 +8
- 材料科学Yuji C. Sasaki 研究室東京大学論文 116 件·共通: 力学, 受容体, ウイルス, 微生物 +7
- 生化学・分子生物学・遺伝学Seiya Imoto 研究室東京大学論文 100 件·共通: ウイルス感染, ウイルス, 感染症, 微生物 +7
- 神経科学Naoki Okamoto 研究室東京大学論文 100 件·共通: ウイルス, 感染症, 環境保全, 環境科学 +7
- 医学Takashi Saito 研究室東京大学論文 193 件·共通: 環境保全, 環境科学, 環境, 地球科学・環境 +9
- 数学Daisuke Yoneoka 研究室東京大学論文 163 件·共通: 感染症, 環境保全, 環境科学, 環境 +7
- 生化学・分子生物学・遺伝学Hiroki Matsui 研究室University of Tokyo Health Sciences論文 102 件·共通: 感染症, 環境保全, 環境科学, 環境 +5
研究成果（26 件）
- DOI: https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1013824
- DOI: https://doi.org/10.64898/2026.03.24.713847
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-025-68062-z
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-025-57728-3
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jmb.2025.169368
- DOI: https://doi.org/10.1021/jacs.4c04648
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-024-53533-6
- DOI: https://doi.org/10.1248/cpb.c24-00409
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.4c00172
- DOI: https://doi.org/10.1172/jci151536
続きを表示（残り 16 件）閉じる
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-023-42764-8
- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms242015423
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2022.11.928
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-023-35844-2
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-022-32019-3
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.2c00946
- DOI: https://doi.org/10.1002/pro.4452
- [2022] 3D-RISM-AI: A Machine Learning Approach to Predict Protein–Ligand Binding Affinity Using 3D-RISMDOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.2c03384
- DOI: https://doi.org/10.2142/biophysico.bppb-v19.0045
- [2022] Supramolecular Mechanosensitive Potassium Channel Formed by Fluorinated Amphiphilic CyclophaneDOI: https://doi.org/10.1021/jacs.2c04118
- DOI: https://doi.org/10.1107/s2059798321002527
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jmb.2021.167324
- DOI: https://doi.org/10.1107/s0108767321085962
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.1c00389
- [2021] Mechanism of Vitamin D Receptor Ligand-Binding Domain Regulation Studied by gREST SimulationsDOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.1c00534
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bmc.2021.116500
科研費（0 件）
まだデータがありません（KAKEN 取り込み後に表示）。
所属学会・役職（0 件）
まだデータがありません（学会データ連携後に表示）。