Mayuko Takeda‐Shitaka 研究室

本研究室は、タンパク質の構造と機能の関係を理解するための計算手法の開発に取り組んでいます。特に、タンパク質の周囲に存在する水分子の位置を予測する手法や、複数のタンパク質分子が集合した複合体の立体構造を推定する問題に焦点を当てています。これらは、タンパク質がどのように働き、他の分子とどのように相互作用するかを解明する上で重要な課題です。 水分子の位置予測では、確率分布に基づいた計算手法を用いて、タンパク質表面の水の位置を効率的にサンプリングする方法を開発しています。一方、タンパク質複合体の構造予測については、複数のグループが参加する国際的な比較実験に携わり、予測精度の評価と改善に貢献しています。二量体から高次オリゴマーまで、様々な規模の複合体を対象に、計算モデルがどの程度正確に構造を予測できるかを検証する仕事を行っています。 これらの研究を通じて、コンピュータを使った構造予測手法の信頼性向上と、タンパク質相互作用のより詳細な理解の実現を目指しています。