Kota Kasahara 研究室
主宰者:Kota Kasahara
立命館大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室では、タンパク質と薬剤や他の分子がどのように結合するかを原子レベルで解明することを目指しています。特に、分子が自由に動く状況での結合過程を調べることに力を入れており、従来の実験では直接観察しにくい現象を計算機シミュレーションで再現しています。
主要な手法は、一般化アンサンブル分子動力学法と呼ばれる計算手法です。この方法では、タンパク質と結合相手の分子の両方が柔軟に動く状態をコンピュータ上で模擬し、複数の安定な複合体構造を探索します。タンパク質が本来持つ柔らかさや不規則な領域を考慮できることが特徴で、新型コロナウイルスの酵素や細胞膜上の受容体など、様々な標的タンパク質に対する薬候補化合物の結合様式を評価しています。
こうした計算研究に加えて、遺伝子解析や実験的検証も組み合わせており、腸内微生物と宿主の相互作用や、植物の脂質分子が細胞膜の構造にどう関わるかといった生物学的な問題にも取り組んでいます。複雑な分子的メカニズムを多角的にアプローチすることで、医療や生物学の実際の課題の解決につなげることを目指しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-021-85612-9
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