Ryo Ishibashi 研究室

本研究室は、細胞核内でのDNAの立体構造と遺伝子制御の関係を解明することを目指しています。DNA分子は核の中で複雑に折り畳まれており、遺伝子の機能を制御する重要なタンパク質結合領域（エンハンサーやプロモーター）がどこに位置し、どのような構造で機能しているかは、これまで十分に理解されていません。 研究室では、染色体の相互作用を測定する高スループット解析技術（Hi-C法）により得られたゲノムデータを、統計的な次元削減手法である多次元尺度構成法（MDS）を用いて解析しています。Hi-Cデータは、DNA上の離れた領域がどの程度物理的に接近しているかを大規模に測定したもので、これを距離情報として再解釈することにより、核内でのDNAループの形成位置や構造を可視化し、推定することができます。 このアプローチにより、エンハンサーやプロモーターなどの遺伝子制御要素の配置をより正確に特定できる可能性が示されています。生物学的実験と情報解析を組み合わせることで、遺伝子がいつどのように制御されるのかという生命現象の基本的な仕組みの理解が進むことが期待されています。