Hideo Doi 研究室
主宰者:Hideo Doi
立教大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、分子間相互作用を定量的に評価するための計算理論と手法の開発、およびそれを応用した材料設計・医学利用の研究を行っています。主要な計算手法は、フラグメント分子軌道(FMO)法で、これは大規模な分子系統を断片化して解析することで、各原子残基間の相互作用エネルギーを高速かつ詳細に計算できます。研究室では独自の汎用プログラムABINIT-MPを開発・継続改良しており、GPU加速や高精度計算への対応を進めています。
FMO計算で得られた相互作用パラメータは、粗視化シミュレーション(散逸粒子動力学法)と組み合わせることで、膜内のポア形成、脂質ドメイン形成、タンパク質の構造変化など、ナノからマイクロスケールの現象を予測します。医薬品開発への応用として、抗凝固薬の標的酵素との結合モード解析や蚊忌避剤とその受容体の相互作用解析も行い、実験では観察困難な分子レベルのメカニズムを理論的に明らかにしています。さらに機械学習により計算コストを削減し、液晶エラストマーなどの高分子材料の物性予測にも展開しており、微視的な分子情報から巨視的な材料特性を予測する学際的な研究を展開しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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- DOI: https://doi.org/10.2477/jccj.2023-0040
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- DOI: https://doi.org/10.2477/jccj.2024-0022
- DOI: https://doi.org/10.2477/jccj.2024-0029
- DOI: https://doi.org/10.1002/jcc.27297
- DOI: https://doi.org/10.2477/jccj.2023-0019
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- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-022-23897-0
- DOI: https://doi.org/10.1021/acsomega.1c06587
- DOI: https://doi.org/10.2477/jccj.2022-0037
- DOI: https://doi.org/10.2324/gomu.95.54
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpca.1c06685
- DOI: https://doi.org/10.1002/jcc.26707
- DOI: https://doi.org/10.1063/5.0049258
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