Kazuki Akisawa 研究室

主宰者：Kazuki Akisawa
立教大学

AI 要約（直近 5 年の研究成果）

当研究室は、タンパク質と低分子化合物（薬剤や天然物）、あるいはタンパク質同士の相互作用を理論的に解明することを目指しています。具体的には、ウイルス感染の初期段階に関わるスパイクタンパク質、新型コロナウイルスのプロテアーゼ、血液凝固に関わるタンパク質など、生物学的に重要な対象システムを研究しており、これらの分子がどのような相互作用により機能しているかを明らかにしようとしています。 研究の手法は、量子化学計算と分子動力学シミュレーションの組み合わせが特徴です。フラグメント分子軌道法（FMO）と呼ばれる計算手法を用いて、大規模なタンパク質系を扱うことができます。この方法により、タンパク質内の個々のアミノ酸残基とリガンド（薬物など）の相互作用を、エネルギーレベルで詳細に評価することが可能になります。また、生理条件下での構造ゆらぎを考慮するため、古典的な分子動力学シミュレーションで生成された多数の構造に対して計算を行い、統計的に相互作用を解析します。 これらの研究から得られた知見の一例として、直接作用型の抗凝固薬が同じターゲットタンパク質に対して、共通点と相違点の両方を持つバインディングパターンを示すことが明らかになっています。同様に、スパイクタンパク質の変異型では受容体への親和性が高まることも報告されています。さらに研究室では、計算プログラムABINIT-MPの開発・改良にも取り組んでおり、より正確で効率的な分析ツールの構築も進めています。

※ AI（Claude）が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。

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