Ryo Hatada 研究室
主宰者:Ryo Hatada
立教大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、タンパク質や医薬品分子などの生体高分子システムにおける相互作用を、計算化学的手法により詳細に解析する研究を行っています。特に、電子相関を考慮した量子化学計算(フラグメント分子軌道法)と古典分子動力学シミュレーションを組み合わせることで、生理的条件に近い動的な構造変化を反映させながら、タンパク質内の個々のアミノ酸残基間の相互作用エネルギーを統計的に評価しています。
研究の中心的なテーマとしては、新型コロナウイルスの感染機構に関わるウイルスタンパク質の解析が挙げられます。ウイルスの主プロテアーゼやスパイクタンパク質と、人間の受容体タンパク質や抗体との結合様式および相互作用の強さを予測・評価することで、既存医薬品の再配置や新規阻害剤の開発支援に貢献しています。特に、多数の動的構造サンプルから得られる相互作用データを統計解析することで、静的な構造解析では見落とされる重要な相互作用パターンや、ウイルス変異に伴う結合特性の変化を明らかにしています。
さらに、大規模な計算コストを軽減するため、機械学習を用いた予測手法の開発も進めており、より実用的で迅速な解析パイプラインの構築を目指しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果(12 件)
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- DOI: https://doi.org/10.35848/1882-0786/ac4300
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.1c02788
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.1c03043
- DOI: https://doi.org/10.35848/1882-0786/abdac6
- DOI: https://doi.org/10.35848/1347-4065/ac1857
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- [2021] Interaction analyses of SARS-CoV-2 spike protein based on fragment molecular orbital calculationsDOI: https://doi.org/10.1039/d0ra09555a
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