Daniel R. Mende 研究室
主宰者:Daniel R. Mende
慶應義塾大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
この研究室は、環境サンプルや人体から得られた遺伝物質を解析し、微生物群集の多様性と機能を明らかにすることを目指しています。特に、培養が困難な微生物を含む自然界の微生物相の全体像を捉えるために、メタゲノミクス(複数の微生物の遺伝情報を一度に解読する手法)を活用した研究を展開しています。海洋環境や人間の腸内環境、土壌などの多様な環境における微生物の存在状況と相互作用を調べています。
研究室では、膨大な公開データベースから微生物の遺伝情報を整理・統合し、誰でも利用できるデータベースやツール(mOTUやproGenomesなど)を開発・提供しています。これらのリソースにより、新たに発見される未知の微生物種を効率的に同定したり、既知の微生物の機能を詳細に分類したりすることが可能になります。また、特定の微生物グループの食物利用能力や代謝能力の多様性、および微生物の遺伝的な特性と疾患リスクの関連性など、具体的な生物現象の解明にも取り組んでいます。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
外部リンク
関連研究室(8 件)
- 材料科学Takeharu Tsuge 研究室東京工業大学論文 96 件·共通: 細菌・微生物, 細菌・ウイルス, 微生物・ウイルス学, 地球システム変動 +9
- 環境科学Kazuya Shimizu 研究室筑波大学論文 93 件·共通: 細菌・微生物, 細菌・ウイルス, 微生物・ウイルス学, 地球システム変動 +8
- 医学Yasuhiro Shimojima 研究室Shinshu University Hospital論文 100 件·共通: データベースシステム, データベース・大規模処理, データ管理・基盤, データ科学 +4
- 医学Masaru Obokata 研究室群馬大学論文 100 件·共通: データベースシステム, データベース・大規模処理, データ管理・基盤, データ科学 +2
- 医学Hideki Ishii 研究室群馬大学論文 100 件·共通: データベースシステム, データベース・大規模処理, データ管理・基盤, データ科学 +2
- 社会科学Toshihiro Isobe 研究室東京工業大学論文 100 件·共通: 細菌・ウイルス, 微生物・ウイルス学, 地球システム変動, 環境動態科学 +6
- 歯学Yasushi Shimada 研究室東京医科歯科大学論文 87 件·共通: 細菌・微生物, 細菌・ウイルス, 微生物・ウイルス学, 免疫・微生物学 +3
- 材料科学Yufeng Zheng 研究室熊本大学論文 100 件·共通: 地球システム変動, 環境動態科学, 環境動態・生態, 免疫・微生物学 +4
研究成果(31 件)
- DOI: https://doi.org/10.1186/s12889-025-25653-1
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41564-026-02354-y
- DOI: https://doi.org/10.1099/mgen.0.001702
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41564-026-02314-6
- DOI: https://doi.org/10.1186/s41043-025-00774-w
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkaf1208
- DOI: https://doi.org/10.1099/acmi.0.000541.v4
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkae1004
- DOI: https://doi.org/10.3389/fcimb.2024.1384809
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-024-46165-3
続きを表示(残り 21 件)閉じる
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkad943
- [2023] mOTUs databaseDOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.7778108
- DOI: https://doi.org/10.1136/bmjgh-2023-edc.315
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkac1078
- DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-022-01410-z
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkac1022
- DOI: https://doi.org/10.1016/s2666-5247(22)00088-x
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41592-022-01431-4
- DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.854355
- [2022] Benchmarking the topological accuracy of bacterial phylogenomic workflows using in silico evolutionDOI: https://doi.org/10.1099/mgen.0.000799
- [2022] Complex marine microbial communities partition metabolism of scarce resources over the diel cycleDOI: https://doi.org/10.1038/s41559-021-01606-w
- [2021] mOTUs v2 databaseDOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.4721452
- DOI: https://doi.org/10.1099/ijsem.0.004609
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-021-04233-4
- [2021] mOTUs v2 databaseDOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.4588372
- [2021] mOTUs databaseDOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.5012106
- DOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.5729969
- DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-021-01119-5
- DOI: https://doi.org/10.1002/cpz1.218
- [2021] mOTUs databaseDOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.5140350
- DOI: https://doi.org/10.1186/s13059-021-02393-0
科研費(0 件)
まだデータがありません(KAKEN 取り込み後に表示)。
所属学会・役職(0 件)
まだデータがありません(学会データ連携後に表示)。