Yukichi Kitamura 研究室
主宰者:Yukichi Kitamura
静岡大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
北村研究室では、分子や生体システムの構造と機能を理解するために、振動分光スペクトルと計算機シミュレーションを組み合わせた研究を進めています。具体的には、赤外線やラマン分光で得られるスペクトルの周波数変化が、どのような分子間相互作用や電場環境によって生じるのかを解明することを目指しています。そのために、量子化学計算と分子動力学シミュレーションの結果をもとに、電場などの記述子を用いた機械学習モデルを構築し、スペクトル特性と分子の局所的な環境との対応関係を定量的に記述しています。
これらの手法は、電解質溶液や水素結合系など、様々な液体・溶液系の分子間構造を調べるために応用されています。また、生理機能に直結する蛋白質の構造変化にも適用されており、特にヘモグロビンのアロステリック制御機構を対象として、プロトン化状態や塩化物イオンがタンパク質の四次構造や状態遷移に与える影響を分析しています。さらに、pH依存的な物理化学的性質を原子レベルで計算するための新しいシミュレーション手法の開発も進めており、生体分子の複雑な機能メカニズムを原子的な視点から理解することに貢献しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果(8 件)
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- DOI: https://doi.org/10.1016/j.aichem.2025.100098
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.3c07146
- DOI: https://doi.org/10.1002/jrs.6356
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.cplett.2022.139624
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.1c07520
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.0c00939
- DOI: https://doi.org/10.2477/jccj.2021-0045
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