Noriyuki Kurita 研究室（豊橋技術科学大学）

AI 要約（直近 5 年の研究成果）

本研究室は、生物学的に重要なタンパク質と医薬品候補物質の相互作用を、量子化学計算によって詳細に解析する研究に取り組んでいます。具体的には、抗結核薬、アルツハイマー病治療薬、ビタミンD受容体阻害剤など、感染症や神経疾患に関連するタンパク質をターゲットとし、これらのタンパク質と低分子化合物がどのような相互作用を示すかを電子レベルで調査しています。主な手法として、フラグメント分子軌道法（FMO法）と呼ばれる高精度な量子化学計算法を活用しています。この手法は、タンパク質を小さな部分に分割して計算することで、従来の分子力学シミュレーションでは得難い電子的な相互作用を正確に評価できます。また、金属イオンを含むタンパク質に対しては、量子力学と古典的分子力学を組み合わせた混合手法（QM/MM法）を適用し、活性サイトの電子状態をより正確に記述しています。これらの計算結果は、既存の実験データと高い一致性を示し、新規医薬品候補物質の設計に直結しています。さらに、FMO計算データの蓄積と共有を目的とした公開データベース（FMODB）を構築し、世界規模で創薬研究を支援する基盤整備も進めています。

※ AI（Claude）が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。

外部リンク

研究成果（19 件）

[2026] Proposal of novel CYP3A4 inhibitors: Molecular simulations based on molecular mechanics and ab initio fragment molecular orbital methods
DOI: https://doi.org/10.1016/j.insi.2026.100373
[2026] Specific interactions between fluorinated vitamin-D3 derivatives and vitamin-D receptor: molecular mechanics and ab initio fragment molecular orbital calculations
DOI: https://doi.org/10.1007/s00894-025-06623-1
[2025] Cooperative inhibition in cytochrome P450 between a substrate and an apparent noncompetitive inhibitor
DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2025.108513
[2025] Efficiency of QM/MM optimization and fragment molecular orbital calculations for investigating interactions between zinc metalloprotease and its inhibitors
DOI: https://doi.org/10.1016/j.jmgm.2025.108977
[2025] Designing Novel InhA Inhibitors for Antituberculosis Agents Using ab Initio Fragment Molecular Orbital Calculations
DOI: https://doi.org/10.1021/acsomega.5c02912
[2024] Modification of MM force fields around heme-Fe in the CYP–ligand complex and ab initio FMO calculations for the complex
DOI: https://doi.org/10.1016/j.jmgm.2024.108875
[2023] In Silico Design of Natural Inhibitors of ApoE4 from the Plant Moringa oleifera: Molecular Docking and Ab Initio Fragment Molecular Orbital Calculations
DOI: https://doi.org/10.3390/molecules28248035
[2023] Elucidating specific interactions for designing novel pyrrolamide derivatives as potential GyrB inhibitors based on <i>ab initio</i> fragment molecular orbital calculations
DOI: https://doi.org/10.1080/07391102.2023.2291178
[2023] Proposal of novel ApoE4 inhibitors from the natural spice Cinnamon for the treatment of Alzheimer's disease: Ab initio molecular simulations
DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpc.2023.106990
[2022] Structure-based drug design of novel M. tuberculosis InhA inhibitors based on fragment molecular orbital calculations
DOI: https://doi.org/10.1016/j.compbiomed.2022.106434

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[2022] Natural inhibitors for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 main protease from Moringa oleifera, Aloe vera, and Nyctanthes arbor-tristis: molecular docking and ab initio fragment molecular orbital calculations
DOI: https://doi.org/10.1007/s11224-022-02021-y
[2022] FMO calculations for zinc metalloprotease:Fragmentation of amino-acid residues coordinated to zinc ion
DOI: https://doi.org/10.1273/cbij.22.21
[2022] Water molecule-mediated selective inhibition of bacterial zinc metalloproteinases by non-hydroxamate compounds: Ab initio molecular simulations
DOI: https://doi.org/10.1016/j.jmgm.2022.108200
[2021] Proposal of selective inhibitor for bacterial zinc metalloprotease: Molecular mechanics and ab initio molecular orbital calculations
DOI: https://doi.org/10.1016/j.jmgm.2021.108047
[2021] FMODB: The World’s First Database of Quantum Mechanical Calculations for Biomacromolecules Based on the Fragment Molecular Orbital Method
DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.0c01062
[2021] Single-molecule junction spontaneously restored by DNA zipper
DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-25943-3
[2021] Proposal of novel natural inhibitors of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 main protease: Molecular docking and ab initio fragment molecular orbital calculations
DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpc.2021.106608
[2021] Proposal of novel potent inhibitors against androgen receptor based on ab initio molecular orbital calculations
DOI: https://doi.org/10.1016/j.jmgm.2021.107873
[2021] Specific interactions between the alkaline protease of P. aeruginosa and its natural peptide inhibitor: ab initio molecular simulations
DOI: https://doi.org/10.1007/s00894-021-04991-y

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