Narutoshi Kamiya 研究室

主宰者：Narutoshi Kamiya
兵庫県立大学

AI 要約（直近 5 年の研究成果）

本研究室は、蛋白質とリガンド（小分子や別の蛋白質）との相互作用メカニズムを、計算機シミュレーションによって解き明かすことを主な研究テーマとしています。特に、複数の安定な状態の間を遷移する柔軟な分子系における結合過程に焦点を当てており、従来の実験構造情報に頼らずに、未結合状態からの自発的な結合経路を追跡できるシミュレーション手法の開発に力を入れています。 具体的には、マルチカノニカル分子動力学法や仮想システム結合分子動力学法などの拡張アンサンブル法を開発・活用し、蛋白質の柔軟な結合ポケット（特に「隠れた結合サイト」）や内在的に無秩序な領域への結合を研究しています。免疫応答に関わるMR1蛋白質と細菌由来リガンドの認識、腫瘍抑制蛋白質Bcl-xL阻害剤の結合、GPCRと医薬品候補分子の相互作用、リボソイムやDNAアプタマーの配位など、様々な生物学的に重要なシステムを対象としています。 さらに、人工知能を用いた新しい力場の開発や、超音波により計算を加速させる手法の工夫により、従来は到達困難だった時間スケールの現象をシミュレーションで再現する試みも進めています。これらの研究成果は、医薬品開発やバイオ材料設計への応用につながる可能性を持っています。

※ AI（Claude）が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。

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