Hisashi Okumura 研究室
主宰者：Hisashi Okumura
総合研究大学院大学
AI 要約（直近 5 年の研究成果）
本研究室では、タンパク質の異常な凝集現象を分子規模で理解することを中心課題としています。特にアルツハイマー病に関連するアミロイドベータペプチドや、ポリグルタミン病に関わるタンパク質の凝集過程を、コンピュータシミュレーションを用いて研究しています。水溶液中での凝集、生体膜やタンパク質表面などの界面での集合体形成、そして凝集を阻害する物質の作用機序まで、多角的にアプローチしています。
これらの現象を調べるために、分子動力学シミュレーションという手法を活用しています。従来の方法では計算時間がかかりすぎて観察できなかった、初期段階の凝集から成熟した線維状構造への成長プロセス全体を追跡できるよう、新たなシミュレーション手法の開発と改良も進めています。さらに超音波やレーザー照射によるアミロイド線維の破壊メカニズムの解析、天然物や薬剤候補化合物による凝集抑制の原理解明など、治療への応用を見据えた研究も展開しています。
加えて、細胞間の力学的相互作用の測定やセンサータンパク質の構造変化、ウイルスタンパク質の動的性質など、生命現象の多様な場面におけるタンパク質の振る舞いを、計算化学の手法で解き明かそうとしています。
※ AI（Claude）が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果（37 件）
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- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.5c01837
- [2024] Nonequilibrium Molecular Dynamics Method to Generate Poiseuille-Like Flow between Lipid BilayersDOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.4c00750
- DOI: https://doi.org/10.1021/jacs.4c08841
- DOI: https://doi.org/10.3389/fcell.2024.1414601
- DOI: https://doi.org/10.1021/acschemneuro.4c00276
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- DOI: https://doi.org/10.2142/biophysico.bppb-v20.0045
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.3c06051
- DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0291093
- DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1011306
- DOI: https://doi.org/10.1021/acschemneuro.3c00192
- DOI: https://doi.org/10.4131/jshpreview.33.76
- DOI: https://doi.org/10.2477/jccj.2023-0020
- DOI: https://doi.org/10.1021/acschemneuro.2c00358
- DOI: https://doi.org/10.1002/jcc.27020
- [2022] State-of-the-Art Molecular Dynamics Simulation Studies of RNA-Dependent RNA Polymerase of SARS-CoV-2DOI: https://doi.org/10.3390/ijms231810358
- [2022] Application study of infrared free-electron lasers towards the development of amyloidosis therapyDOI: https://doi.org/10.1107/s1600577522007330
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- DOI: https://doi.org/10.3390/molecules27082483
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.cpc.2022.108362
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- DOI: https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2021.e06102
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2021.07.026
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- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.0c11491
- DOI: https://doi.org/10.1038/s42003-021-01776-0
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.0c01056
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