Yosuke Nishimura 研究室
主宰者:Yosuke Nishimura
海洋研究開発機構
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、海洋や温泉などの環境から採取した試料中のRNA(遺伝物質の一種)を調べ、未知のウイルスやそれらが持つ遺伝子を発見することを目指しています。特に、二本鎖RNA配列を選別して解析する手法を用いることで、従来の方法では見つけられなかったウイルスの多様性を明らかにしています。微生物環境中に存在する数多くのRNA由来ウイルスを網羅的に調査し、それらの進化的な関係性を解析することで、ウイルスの分類体系を再構築する研究にも取り組んでいます。
同時に、微生物が光を感知して機能する「ロドプシン」というタンパク質に着目し、その多様性と生理機能を研究しています。光合成を行う藍藻類や珪藻といった海洋微生物がどのようなロドプシンを保有しており、それがエネルギー獲得や物質代謝にどう機能しているかを、遺伝情報の解析と実験的な検証を組み合わせて調べています。これらの研究を通じて、環境中の微生物がどのようにウイルスに感染し、海洋の物質循環に寄与しているかについての理解を深めています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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関連研究室(8 件)
- 免疫学・微生物学Ikuo Hırono 研究室東京海洋大学論文 94 件·共通: 細菌・微生物, 細菌・ウイルス, 微生物・ウイルス学, 解析学一般 +9
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- 環境科学Kazuya Shimizu 研究室筑波大学論文 93 件·共通: 細菌・微生物, 細菌・ウイルス, 微生物・ウイルス学, 解析学 +7
- 医学Takashi Yokoo 研究室東京慈恵会医科大学論文 100 件·共通: RNA生物学分野, 解析学一般, 解析学基礎, 実・複素解析 +6
- 医学Nobuo Tsuboi 研究室東京慈恵会医科大学論文 100 件·共通: RNA生物学分野, 解析学一般, 解析学基礎, 実・複素解析 +6
- 医学Tetsushi Yoshikawa 研究室藤田医科大学論文 100 件·共通: ウイルス・微生物叢, 細菌・ウイルス, 微生物・ウイルス学, 遺伝子発現制御 +4
研究成果(16 件)
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-026-71096-6
- DOI: https://doi.org/10.1099/mgen.0.001491
- [2025] Carotenoids bind rhodopsins and act as photocycle-accelerating pigments in marine BacteroidotaDOI: https://doi.org/10.1038/s41564-025-02109-1
- DOI: https://doi.org/10.1093/ismejo/wraf139
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.micpath.2024.107013
- DOI: https://doi.org/10.3389/fviro.2024.1371958
- DOI: https://doi.org/10.1128/mra.00038-24
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41564-023-01579-5
- [2024] DiGAlign: Versatile and Interactive Visualization of Sequence Alignment for Comparative GenomicsDOI: https://doi.org/10.1264/jsme2.me23061
- [2024] Cyanorhodopsin-II represents a yellow-absorbing proton-pumping rhodopsin clade within cyanobacteriaDOI: https://doi.org/10.1093/ismejo/wrae175
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- DOI: https://doi.org/10.3390/s23115246
- [2023] Distribution and survival strategies of endemic and cosmopolitan diazotrophs in the Arctic OceanDOI: https://doi.org/10.1038/s41396-023-01424-x
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-023-34125-8
- DOI: https://doi.org/10.1128/msystems.00931-22
- DOI: https://doi.org/10.1264/jsme2.me23015
- [2022] シアノバクテリアの光合成とは異なる光エネルギー利用機構DOI: https://doi.org/10.1271/kagakutoseibutsu.60.165
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