Takuya Fujie 研究室

Fujie研究室は、医薬品開発を計算科学の視点から支援する研究に取り組んでいます。特に環状ペプチドという新しい医薬品の候補物質に着目し、その細胞膜への透過性を理解・予測することを目指しています。環状ペプチドは従来の医薬品では到達困難な細胞内のタンパク質相互作用を標的にできる有望な物質ですが、膜を通りにくいという課題があり、この課題の解決が重要な研究テーマとなっています。 研究手法としては、分子動力学シミュレーションという計算方法を用い、ペプチド分子が脂質膜を透過する過程を原子レベルで再現しています。多数のペプチド化合物について大規模な計算を実施し、膜透過性を予測するプロトコルを開発するとともに、実験データとの比較検証も行っています。並行して、膜を構成する脂質の種類や濃度が透過性予測に重要な影響を与えることを明らかにしており、より現実的な膜モデルを用いた解析も進めています。 さらに、研究室では計算基盤の強化にも注力しています。GPU等の高性能計算機を用いた分子シミュレーションの効率化や、量子コンピュータを応用した医薬品スクリーニング問題への新しい取り組みも行っています。また、環状ペプチドの膜透過性に関する実験データを統合したデータベースを構築・公開し、学術界全体の医薬品開発を支援する基盤整備も実施しています。