Jaewoon Jung 研究室
主宰者:Jaewoon Jung
理化学研究所・RIKEN Center for Computational Science
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、生体分子の構造変化と機能を計算機シミュレーションにより解明することを目指しています。特に、タンパク質やペプチド、核酸などの生体高分子が、どのような相互作用を通じて複雑な構造変化を示し、その変化がどのように生理機能に結びつくのかを調べています。対象となる現象は多岐にわたり、神経変性疾患や感染症の原因となるタンパク質の凝集、イオンポンプによる物質輸送の仕組み、ウイルスタンパク質の感染機構など、医学的に重要なテーマが含まれます。
手法としては、全原子分子動力学シミュレーション(すべての原子を個別に扱う計算)と粗視化シミュレーション(複数の原子をまとめて扱う計算)を組み合わせています。これにより、秒単位の長時間現象から原子レベルの詳細な相互作用まで、複数の時間・空間スケールでの現象を追跡することが可能です。また、これらの計算手法を実装した「GENESIS」という高性能分子動力学シミュレーション用ソフトウェアを開発し、スーパーコンピュータを用いた大規模な生体システムの解析を実現しています。
主な成果として、アルツハイマー病の進行が脳だけでなく末梢臓器の炎症と関連していること、タンパク質の内部構造がその機能的な液液相分離や凝集に影響を与えること、膜タンパク質による物質輸送に関わる中間体構造が一時的な相互作用により安定化されることなどを報告しています。これらの知見は、疾患メカニズムの理解と治療薬開発につながる基礎知見となっています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2021.11.491
- DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.2105507118
- [2021] Elucidation of interactions regulating conformational stability and dynamics of SARS-CoV-2 S-proteinDOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2021.01.012
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.1c00185
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