Yuxuan Pang 研究室
主宰者:Yuxuan Pang
東京大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、生物学的な配列データや画像データに対して機械学習・深層学習の手法を適用し、医学や生命科学上の課題を解決することを目指しています。主な研究対象は、抗菌性ペプチドや抗がん性ペプチドなどの生理活性ペプチドの機能予測、がん関連の遺伝子異常やタンパク質修飾の解析、微生物群集中の特定微生物の検出などです。これらの課題に対して、DNA配列やアミノ酸配列を画像化する手法や、Transformer型ニューラルネットワーク、カプセルネットワークといった先進的なニューラルネットワークアーキテクチャを活用した予測モデルの開発を行っています。
さらに、生物学的データベースの構築・統合も重要な活動です。抗菌性ペプチドに関する情報を網羅的に集約したデータベースや、タンパク質の化学的修飾に関する大規模データベースを整備し、それらを公開リソースとして提供しています。これらのデータベースには、実験的に検証された大量の情報や、構造予測結果が含まれており、臨床応用や基礎研究を支援する基盤となっています。このように、計算手法によるデータ解析と、検証済み情報の体系的な統合を両輪とすることで、薬剤耐性菌対策やがん治療への貢献を目指しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
外部リンク
関連研究室(8 件)
- 医学Yoshihisa Miyamoto 研究室東京大学論文 137 件·共通: ネットワーク・セキュリティ, ネットワーク, データベース, 計算機科学 +7
- 医学Satoru Miyano 研究室東京大学論文 100 件·共通: ネットワーク・セキュリティ, ネットワーク, RNA, 学習 +9
- 神経科学Kazuyuki Aihara 研究室東京大学論文 158 件·共通: ネットワーク・セキュリティ, ネットワーク, 学習, 微生物 +8
- 意思決定科学Yuki Kataoka 研究室京都大学論文 100 件·共通: データベース, 計算機科学, システム, 学習 +8
- 医学Shinji Tanaka 研究室東京大学論文 149 件·共通: データベース, 計算機科学, システム, 学習 +8
- 医学Kaori Koga 研究室東京大学論文 187 件·共通: データベース, RNA, 計算機科学, システム +8
- 計算機科学Kiyoharu Aizawa 研究室東京大学論文 132 件·共通: ネットワーク・セキュリティ, ネットワーク, 学習, 情報工学 +5
- 保健専門職Gojiro Nakagami 研究室東京大学論文 127 件·共通: RNA, 計算機科学, システム, 学習 +9
研究成果(41 件)
- DOI: https://doi.org/10.1093/bib/bbag023
- [2025] PharaCon: a new framework for identifying bacteriophages via conditional representation learningDOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btaf085
- DOI: https://doi.org/10.1093/bib/bbaf174
- [2025] PharaCon: a new framework for identifying bacteriophages via conditional representation learningDOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btaf085
- DOI: https://doi.org/10.1093/bib/bbaf174
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2024.109333
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkae1005
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.4c00546
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.4c00546
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkae1019
続きを表示(残り 31 件)閉じる
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkae1005
- DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1012068
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2024.109333
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkae1019
- DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1012068
- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms24054328
- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms24054328
- DOI: https://doi.org/10.1093/bib/bbad330
- DOI: https://doi.org/10.1093/bib/bbad330
- DOI: https://doi.org/10.3390/app13126965
- DOI: https://doi.org/10.3390/app13126965
- DOI: https://doi.org/10.1155/2022/1917704
- DOI: https://doi.org/10.1093/bib/bbac497
- DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btac711
- DOI: https://doi.org/10.1093/bib/bbac497
- DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btac711
- DOI: https://doi.org/10.56028/ijcit.1.2.11
- DOI: https://doi.org/10.3847/1538-4365/ac7f3e
- DOI: https://doi.org/10.1155/2022/1917704
- DOI: https://doi.org/10.56028/ijcit.1.2.11
- DOI: https://doi.org/10.3847/1538-4365/ac7f3e
- DOI: https://doi.org/10.1093/database/baab010
- DOI: https://doi.org/10.2139/ssrn.3837632
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkab1080
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkab1017
- DOI: https://doi.org/10.1093/bib/bbab263
- DOI: https://doi.org/10.1093/database/baab010
- DOI: https://doi.org/10.2139/ssrn.3837632
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkab1080
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkab1017
- DOI: https://doi.org/10.1093/bib/bbab263
科研費(0 件)
まだデータがありません(KAKEN 取り込み後に表示)。
所属学会・役職(0 件)
まだデータがありません(学会データ連携後に表示)。