Hirokazu Toju 研究室
主宰者:Hirokazu Toju
京都大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、土壌や水、植物体内など様々な環境に生息する微生物群集の構造と機能を理解することを中心課題としています。細菌や真菌、古細菌など多数の微生物種が相互作用しながら形成される複雑なコミュニティがどのように安定性を保ち、あるいは急激に変動するのかを明らかにしようとしています。特に、微生物群集が複数の異なる安定した状態を持つ可能性に着目し、それらの状態がどのような環境条件や生態学的プロセスによって決定されるのかを調査しています。
研究アプローチとしては、DNA塩基配列解析(メタバーコーディングやメタゲノミクス)を用いた大規模な群集構造の把握と、室内実験系での時系列解析を組み合わせています。広範な地域・環境を対象とした標本化により、温度や緯度などの環境勾配に沿った微生物多様性の変動パターンを記述し、同時に実験室内で微生物群集の動態を追跡して理論的な予測との照合を行っています。これにより、微生物間の相互作用や機能的な遺伝子の冗長性が群集の安定性や柔軟性にいかに影響するかを解明しています。
得られた知見は、植物の耐性向上、動物の健康維持、農業生産性の向上など、実際的な課題への応用につながる可能性を持つものです。個別の微生物種の役割だけでなく、複数種の組み合わせがもたらす相乗効果や相殺効果も検討することで、マイクロバイオームを制御・管理する際の科学的基盤を構築しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果(20 件)
- DOI: https://doi.org/10.1111/1365-2745.70289
- DOI: https://doi.org/10.1093/ismejo/wrag085
- DOI: https://doi.org/10.1186/s40793-025-00688-4
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-025-56470-0
- DOI: https://doi.org/10.1186/s40793-024-00628-8
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-024-07658-9
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41597-024-03410-0
- DOI: https://doi.org/10.1128/msphere.00803-23
- DOI: https://doi.org/10.1093/pnasnexus/pgae047
- DOI: https://doi.org/10.1093/ismeco/ycae007
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- DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1302167
- [2023] Metagenomic analysis of ecological niche overlap and community collapse in microbiome dynamicsDOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1261137
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41559-023-02130-9
- DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-023-01474-5
- DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1153952
- DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-023-01498-x
- DOI: https://doi.org/10.3389/fevo.2022.959945
- DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.713180
- DOI: https://doi.org/10.1007/s00442-021-04868-0
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