Erik Walinda 研究室
主宰者:Erik Walinda
京都大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、タンパク質の構造と動態を原子レベルで解明する研究に取り組んでいます。主な対象は、タンパク質の修飾分子であるユビキチンおよびそれを認識する関連タンパク質、神経変性疾患に関連する凝集性タンパク質、そして生体内でのタンパク質の相互作用です。これらの現象を理解することで、免疫応答の制御メカニズムや神経変性疾患の発症メカニズムの解明につながります。
研究手法としては、核磁気共鳴(NMR)分光法を中核としており、特に流動下でのNMR測定法を開発・応用しています。この手法により、タンパク質凝集の過程をリアルタイムで原子レベルの分解能で観察することが可能になります。また、分子動力学シミュレーション計算を組み合わせることで、実験結果を補完し、タンパク質の動きをより詳細に理解しています。さらに、結合実験や安定性評価も系統的に行っています。
主要な発見としては、複数のタンパク質で、構造が固いと考えられていた領域にも動きがあり、この動力学的な性質が機能に影響することが明らかになっています。特にユビキチンチェーン認識では、環状化による動力学の変化が結合親和性を変調すること、また他分子との弱い相互作用がタンパク質の安定性や凝集を調節することが示されました。これらの知見は、生体内でのタンパク質機能を制御する新たなメカニズムを示唆しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果(21 件)
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- DOI: https://doi.org/10.1016/j.pep.2024.106560
- [2024] A de novo dominant-negative variant is associated with OTULIN-related autoinflammatory syndromeDOI: https://doi.org/10.1084/jem.20231941
- DOI: https://doi.org/10.1002/pro.4768
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.3c01683
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2023.105165
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- [2022] Rheo‐NMR Spectroscopy for Cryogenic‐Probe‐Equipped NMR Instruments to Monitor Protein AggregationDOI: https://doi.org/10.1002/cpz1.617
- [2022] Counter-flow phenomena studied by nuclear magnetic resonance (NMR) velocimetry and flow simulationsDOI: https://doi.org/10.1063/5.0097543
- DOI: https://doi.org/10.1021/acsomega.1c04917
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.pep.2021.105953
- DOI: https://doi.org/10.1021/jacs.0c13118
- DOI: https://doi.org/10.1007/s12104-021-10041-8
- DOI: https://doi.org/10.1021/jacs.1c02974
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2021.05.031
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.0c11162
- [2021] Structural Dynamic Heterogeneity of Polyubiquitin Subunits Affects Phosphorylation SusceptibilityDOI: https://doi.org/10.1021/acs.biochem.0c00619
- DOI: https://doi.org/10.1039/d1cp03175a
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