Fumitaka Inoue 研究室
主宰者:Fumitaka Inoue
京都大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、DNA配列がどのように遺伝子の働きを制御するかを解明する研究を行っています。特に、タンパク質をコードしない領域(非コーディング領域)に含まれる調節配列に注目し、これらが遺伝子発現にどのような影響を与えるかを調べています。また、ヒトと他の霊長類の遺伝的差異や、精神疾患・発達障害と関連する遺伝変異の機能的役割を明らかにしようとしています。
研究手法として、大規模並列リポーター検定法(MPRA)という高速スクリーニング技術を中心に用いています。この技術により、数十万から百万規模の候補配列を同時に機能検査できます。さらに、深層学習を用いた予測モデルの開発、単一細胞レベルの遺伝子発現解析、脳組織の三次元ゲノム構造の分析など、複数の生物学的手法を組み合わせています。これにより、神経発達や細胞分化の過程で調節配列がいかに動的に機能するかを調査しています。
主な成果として、遺伝子制御に必要な転写因子結合部位の向きと配置が遺伝子活性に大きく影響すること、ヒト特有の加速進化領域が三次元ゲノム構造の再編成と関連していること、精神疾患患者の脳組織において特定の細胞型で顕著な遺伝子発現の変化が生じていることなどが報告されています。これらの知見は、遺伝的多様性が形質や疾患にいかに反映されるかの理解に貢献しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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関連研究室(8 件)
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研究成果(22 件)
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- DOI: https://doi.org/10.64898/2026.03.09.707383
- DOI: https://doi.org/10.1186/s12864-025-11639-1
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-024-08430-9
- [2025] A phylogenetic approach uncovers cryptic endogenous retrovirus subfamilies in the primate lineageDOI: https://doi.org/10.1126/sciadv.ads9164
- DOI: https://doi.org/10.1126/science.adh0559
- [2024] Transcriptomic sex differences in postmortem brain samples from patients with psychiatric disordersDOI: https://doi.org/10.1126/scitranslmed.adh9974
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-024-54302-7
- [2024] Optimizing sequence design strategies for perturbation MPRAs: a computational evaluation frameworkDOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkae012
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41588-023-01626-1
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- DOI: https://doi.org/10.1038/s41588-024-01896-3
- DOI: https://doi.org/10.1186/s13059-024-03365-w
- DOI: https://doi.org/10.1126/science.adg5136
- DOI: https://doi.org/10.1126/science.adh1938
- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms24043509
- DOI: https://doi.org/10.1126/science.abm1696
- DOI: https://doi.org/10.7883/yoken.jjid.2023.039
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-023-37960-5
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.neuron.2022.12.026
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-022-28659-0
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.xgen.2022.100111
- DOI: https://doi.org/10.7554/elife.63713
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