Akira Funahashi 研究室
主宰者:Akira Funahashi
慶應義塾大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
Funahashi研究室は、生命現象の仕組みを計算機を用いて解き明かす研究に取り組んでいます。特に、時系列の遺伝子発現データから遺伝子制御ネットワークを推定する手法の開発に力を入れており、ノイズが多い実験データからも正確に遺伝子間の相互作用を抽出できる機械学習モデルの構築を行っています。また、転写因子とその標的遺伝子の結合予測では、タンパク質と DNA の配列情報を組み合わせた深層学習モデルを開発し、未知の転写因子による制御関係の予測も実現しています。
生物が示す複雑な現象の理解に向けて、同研究室は多角的なアプローチを展開しています。極度の乾燥に耐える昆虫の細胞を対象に、ストレス耐性に関わる遺伝子発現の変動と制御ネットワークの全体像を解析しています。一方、哺乳動物の胚や精巣などの組織について、顕微鏡画像から細胞の形態的特徴を自動抽出して発生能力や成熟度を予測する深層学習手法も開発しており、生殖医学への応用を目指しています。さらに、生化学的な実験と数理モデルの組み合わせにより、細胞内でのエネルギー代謝と蛋白質合成の競合メカニズムを明らかにするなど、多様なスケールでの生命システムの動作原理を探求しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果(29 件)
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- DOI: https://doi.org/10.1109/access.2026.3659303
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2026.153267
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-025-06727-x
- DOI: https://doi.org/10.1002/2211-5463.70055
- DOI: https://doi.org/10.1109/access.2025.3527946
- DOI: https://doi.org/10.1093/biolre/ioaf050
- DOI: https://doi.org/10.1541/ieejsmas.145.33
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.compbiomed.2025.111179
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2024.e25494
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- DOI: https://doi.org/10.1038/s41540-024-00401-0
- [2024] Metabolic Tug-of-War between Glycolysis and Translation Revealed by Biochemical ReconstitutionDOI: https://doi.org/10.1021/acssynbio.4c00209
- DOI: https://doi.org/10.3389/fimmu.2023.1282859
- [2023] Titanium Culture Vessel Presenting Temperature Gradation for the Thermotolerance Estimation of CellsDOI: https://doi.org/10.34133/cbsystems.0049
- DOI: https://doi.org/10.1515/jib-2022-0054
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.artmed.2022.102432
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-022-22189-x
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2022.09.108
- [2022] BioSimulators: a central registry of simulation engines and services for recommending specific toolsDOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkac331
- DOI: https://doi.org/10.1364/optcon.453885
- DOI: https://doi.org/10.1093/nargab/lqac029
- DOI: https://doi.org/10.1109/access.2022.3171329
- DOI: https://doi.org/10.15252/msb.202110851
- DOI: https://doi.org/10.3390/pr9101830
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-021-98905-w
- [2021] COVID19 Disease Map, a computational knowledge repository of virus–host interaction mechanismsDOI: https://doi.org/10.15252/msb.202110387
- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms22115798
- DOI: https://doi.org/10.1109/mems51782.2021.9375303
- DOI: https://doi.org/10.1364/jsap.2021.10p_n404_14
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