Yusuke Hiki 研究室
主宰者:Yusuke Hiki
慶應義塾大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
Yusuke Hiki研究室は、生命現象を支配する遺伝子発現制御のメカニズムを、計算解析を用いて解明することに取り組んでいます。時間軸に沿ったリアルな遺伝子発現データから、遺伝子同士がどのような制御ネットワークを形成しているかを推定する問題に対し、深層学習を活用した新しい推定手法の開発に注力しています。従来の手法は人工データに対しては高精度で動作しますが、実際の生物由来のデータはノイズが多く時間サンプリングが粗いため、精度が低下するという課題に対して、新規アルゴリズムで対応しています。さらに、既知の制御タンパク質だけでなく、未知の制御物質による遺伝子制御関係の予測にも機械学習を応用し、遺伝子配列情報と制御タンパク質のアミノ酸配列を組み合わせたモデルの構築も進めています。
生物学的には、極度の乾燥環境で生存できる不思議な昆虫の能力に焦点を当てた研究も展開しています。この昆虫の細胞を用いて、乾燥耐性を実現する遺伝子発現プロファイルの全体像を明らかにし、どの制御タンパク質が主要な役割を果たすかを系統的に調査しています。ゲノム編集技術を組み合わせることで、細胞内シグナル伝達経路の機能を検証し、乾燥耐性獲得のメカニズムを実験的に実証しています。
さらに、感染症の病態メカニズムを計算系統生物学的に理解する国際的なプロジェクトにも参画しており、分子レベルのデータと計算モデルを統合して、医療に応用可能な知見を導き出す研究も行っています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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関連研究室(8 件)
- 医学Ryo Inuzuka 研究室University of Tokyo Hospital論文 109 件·共通: 系統, 進化・系統, 生態・進化, ゲノム +5
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研究成果(9 件)
- DOI: https://doi.org/10.1109/access.2026.3659303
- DOI: https://doi.org/10.1093/nargab/lqag022
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2026.153267
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41540-024-00401-0
- DOI: https://doi.org/10.3389/fimmu.2023.1282859
- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms22115798
- DOI: https://doi.org/10.15252/msb.202110851
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-021-98905-w
- [2021] COVID19 Disease Map, a computational knowledge repository of virus–host interaction mechanismsDOI: https://doi.org/10.15252/msb.202110387
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