Kosuke Ogata 研究室
主宰者:Kosuke Ogata
京都大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、質量分析を中心とした実験手法を用いて、細胞内のタンパク質の構造、機能、相互作用を包括的に解析することに取り組んでいます。特に、ボトムアップ・プロテオミクスと呼ばれる手法を通じて、複雑な生体サンプルから数千種類のタンパク質を同時に検出・定量化し、細胞内で実際に起きている現象を分子レベルで理解することを目指しています。
研究の具体的な取り組みとしては、ペプチド精製や分析効率を高めるための新しい技術開発と、その応用があります。より多くのタンパク質を回収し検出する工夫や、リン酸化されたタンパク質など化学修飾されたタンパク質の分析方法改善に注力しています。さらに、機械学習を活用した予測モデルの構築により、質量分析データの解釈精度を向上させています。
加えて、研究室では得られた大規模なタンパク質情報から細胞内の制御ネットワークを描き出す研究も行っています。特にリン酸化によるシグナル伝達や、タンパク質間の相互作用ネットワークの解析、細胞内タンパク質の構造変化が生じる仕組みなど、タンパク質がどのように細胞の機能を制御しているかを明らかにしようとしています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
外部リンク
関連研究室(8 件)
- 工学Kenji Kawashima 研究室東京大学論文 108 件·共通: ネットワーク・セキュリティ, ネットワーク, 制御, 情報工学 +6
- 計算機科学Kiyoharu Aizawa 研究室東京大学論文 132 件·共通: ネットワーク・セキュリティ, ネットワーク, 情報工学, 機械工学 +5
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研究成果(33 件)
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- DOI: https://doi.org/10.64898/2026.05.22.727149
- DOI: https://doi.org/10.5702/massspectrometry.a0189
- DOI: https://doi.org/10.64898/2026.01.04.697531
- [2025] Bottom-Up Proteomics Under Acidic Conditions Using Protease Type XIII From Aspergillus saitoiDOI: https://doi.org/10.1016/j.mcpro.2025.101469
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41594-025-01647-w
- [2025] UniScore, a Unified and Universal Measure for Peptide Identification by Multiple Search EnginesDOI: https://doi.org/10.1016/j.mcpro.2025.101010
- DOI: https://doi.org/10.1038/s42004-025-01540-z
- [2025] FRI-262-YI Isogenic studies of basal-core promoter and precore mutations in hepatitis B genotype cDOI: https://doi.org/10.1016/s0168-8278(25)01995-6
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- DOI: https://doi.org/10.1055/s-0044-1801186
- DOI: https://doi.org/10.1039/d4cc04452e
- [2024] AP-1B regulates interactions of epithelial cells and intraepithelial lymphocytes in the intestineDOI: https://doi.org/10.1007/s00018-024-05455-1
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2024.108136
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.4c03753
- DOI: https://doi.org/10.5702/massspec.24-002
- DOI: https://doi.org/10.1039/d4cc04070h
- DOI: https://doi.org/10.5702/massspectrometry.a0152
- [2024] Retention time prediction for post-translationally modified peptides: Ser, Thr, Tyr-phosphorylationDOI: https://doi.org/10.1016/j.chroma.2024.464714
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-024-07526-6
- [2024] Extending the Coverage of Lys-C/Trypsin-Based Bottom-up Proteomics by Cysteine S-AminoethylationDOI: https://doi.org/10.1021/jasms.3c00448
- DOI: https://doi.org/10.5702/massspec.s23-08
- DOI: https://doi.org/10.3390/cancers15010078
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.2c00388
- DOI: https://doi.org/10.15583/jpchrom.2022.016
- DOI: https://doi.org/10.1093/hmg/ddac064
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.crmeth.2021.100138
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.1c00185
- DOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.5750874
- DOI: https://doi.org/10.7554/elife.71966
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.1c00444
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2021.102839
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.mcpro.2021.100170
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