Hiroshi Fujisaki 研究室
主宰者:Hiroshi Fujisaki
日本医科大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
藤崎寛研究室では、蛋白質やその他の生命分子の構造変化と機能を、コンピュータを用いた計算や数学的解析によって調べています。主な対象は、細胞膜で物質を運ぶタンパク質や、化学反応を触媒する酵素蛋白質です。これらの分子がどのような経路を通じて構造を変え、その過程でエネルギーがどのように作用するのかを理解することが目標です。
研究では複数のアプローチを組み合わせています。最小自由エネルギー経路を計算する手法や、加重アンサンブル法と呼ばれる希有事象の動力学を効率的にシミュレートする方法、さらには拡散マップなどの機械学習的な次元削減手法を適用しています。分子動力学計算から得られた軌跡データを分析し、分子が複数の状態を遷移する際の時間スケールや遷移経路を抽出しています。
加えて、細胞スケールの現象にも研究を展開しています。傷口の治癒に対する機械的刺激の影響を調べる際には、格子ベースの細胞モデルと反応・拡散方程式を組み合わせたハイブリッドシミュレーションを構築しています。このように分子レベルから細胞レベルまで、複数のスケールで生命現象の仕組みを理論的・計算的に解明することが、この研究室の特徴です。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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関連研究室(8 件)
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研究成果(15 件)
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.5c00852
- DOI: https://doi.org/10.1587/transfun.2025eap1004
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2024.11.399
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2023.11.2798
- DOI: https://doi.org/10.1587/transfun.2024tap0005
- [2024] On Flow Equivalence of the Subshifts Associated with the Stream Version of Asymmetric Binary SystemsDOI: https://doi.org/10.1587/transfun.2025eap1085
- [2024] The Clinical Medicine from the Perspective of Biophysics: Protein Dynamics and Cellular DynamicsDOI: https://doi.org/10.1272/manms.20.232
- DOI: https://doi.org/10.1272/manms.19.279
- DOI: https://doi.org/10.2142/biophysico.bppb-v20.0023
- DOI: https://doi.org/10.1587/transfun.2022tap0007
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- DOI: https://doi.org/10.3390/life12081188
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.0c01280
- DOI: https://doi.org/10.1063/5.0048360
- DOI: https://doi.org/10.1063/5.0047730
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