Tomohiro Shimada 研究室
主宰者：Tomohiro Shimada
明治大学
AI 要約（直近 5 年の研究成果）
本研究室は、大腸菌をモデル生物として、遺伝子の発現制御メカニズムを分子レベルで解明する研究に取り組んでいます。細胞が環境の変化に適応するため、転写因子と呼ばれるタンパク質が遺伝子のオンオフを制御していますが、研究室では未知の転写因子の機能を明らかにし、それらがゲノム上でどの遺伝子を制御しているのかを調べています。ゲノムSELEXという生化学的な手法を用いて、転写因子がDNA上で結合する領域を網羅的に特定し、その生物学的な意味を実験で検証しています。
栄養不足やDNA損傷などのストレス条件下で、細胞がどのようにして生き残るのかが主要な研究テーマです。これまでの研究を通じて、複数の未知の転写因子がストレス応答遺伝子の発現を制御していること、また単一の遺伝子だけを制御する転写因子から多くの遺伝子を一度に制御する転写因子まで、制御対象の規模が多様であることが明らかになっています。さらに、細胞の代謝経路の切り替わりや、セルロース分解産物の利用など、エネルギー代謝の観点からも遺伝子発現ネットワークを解析しており、得られた知見は産業用微生物の育種や医療応用へも貢献する可能性があります。
※ AI（Claude）が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
外部リンク
関連研究室(8 件)
- 社会科学Tetsuya Kitaguchi 研究室東京工業大学論文 100 件·共通: 代謝, 制御, 機械工学, タンパク質 +8
- 医学Hiroshi Itoh 研究室Keio University Hospital論文 100 件·共通: 代謝, 微生物, タンパク質, 生化学 +9
- 生化学・分子生物学・遺伝学Yasushi Okazaki 研究室順天堂大学論文 100 件·共通: ゲノム, DNA, タンパク質, 生化学 +7
- 医学Yasushi Miyazaki 研究室Nagasaki University Hospital論文 100 件·共通: DNA, 制御, 機械工学, 機械・ロボティクス +8
- 医学Shota Tanaka 研究室東京大学論文 110 件·共通: DNA, 制御, 機械工学, 機械・ロボティクス +7
- 医学Masaya Sato 研究室University of Tokyo Hospital論文 112 件·共通: 代謝, 機械工学, 生化学, 機械・ロボティクス +7
- 医学Takahiro Takazono 研究室Nagasaki University Hospital論文 100 件·共通: ゲノム, 制御, 機械工学, 機械・ロボティクス +6
- 医学Tetsuya Yamamoto 研究室神戸大学論文 100 件·共通: ゲノム, 制御, 機械工学, 機械・ロボティクス +6
研究成果（19 件）
- DOI: https://doi.org/10.3390/microorganisms14010134
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-025-85609-8
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.gerinurse.2025.103706
- DOI: https://doi.org/10.1093/dote/doae048
- DOI: https://doi.org/10.1271/kagakutoseibutsu.62.56
- DOI: https://doi.org/10.3390/microorganisms12010115
- DOI: https://doi.org/10.1007/978-1-0716-3930-6_5
- DOI: https://doi.org/10.1099/mgen.0.001015
- DOI: https://doi.org/10.1186/s12934-023-02143-w
- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms24054717
続きを表示（残り 9 件）閉じる
- [2023] Genomic SELEX Reveals Pervasive Role of the Flagella Master Regulator FlhDC in Carbon MetabolismDOI: https://doi.org/10.3390/ijms24043696
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.gie.2022.04.927
- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms23116055
- DOI: https://doi.org/10.1016/s0016-5085(22)61301-5
- [2022] Regulatory role of CsuR (YiaU) in determination of cell surface properties of Escherichia coli K-12DOI: https://doi.org/10.1099/mic.0.001166
- DOI: https://doi.org/10.1002/1873-3468.14151
- DOI: https://doi.org/10.1099/mgen.0.000653
- DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.697803
- DOI: https://doi.org/10.1021/acscentsci.0c01285
科研費（0 件）
まだデータがありません（KAKEN 取り込み後に表示）。
所属学会・役職（0 件）
まだデータがありません（学会データ連携後に表示）。