Takahiro Sakaue 研究室
主宰者:Takahiro Sakaue
青山学院大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
この研究室は、生物学的現象を物理学・数学的手法で理解する「ソフトマター物理」を専門としています。特に、細胞核内の染色質(DNA と結合タンパク質の複合体)の動きや構造がどのように決まるのかを、ポリマー物理学の観点から解き明かそうとしています。研究対象は、静止した構造ではなく、時間とともに変化する動的な現象です。細胞核の大きさが変わるとき、酵素が染色質を切断・再結合するとき、あるいは転写に関わるタンパク質が DNA に結合するときに、染色質がどう動き、どう組織化されるのかを調べています。
手法としては、理論解析と計算機シミュレーション、さらに実験データの解析を組み合わせています。数学的には確率過程や拡散方程式といった統計物理の道具を使い、コンピュータではポリマーの運動を数値シミュレーションで追跡します。また DNA や RNA の原子構造の計算結果から、より大きなスケール(細胞核全体)での振る舞いを推測する「粗視化」という多階層的アプローチも採用しており、微視的な分子相互作用と巨視的な生物現象をつなぐ橋渡しを目指しています。
これまでの研究から、染色質の動きは周囲の「混雑した環境」に支配されること、酵素が実際に作用する方式によって染色質の構造が大きく変わること、そして転写制御に関わるタンパク質の機能が DNA の力学的性質と深く結びついていることが明らかになってきています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果(15 件)
- DOI: https://doi.org/10.1039/d5sm00555h
- DOI: https://doi.org/10.1088/1751-8121/ad6ab7
- DOI: https://doi.org/10.1103/physrevlett.132.058401
- DOI: https://doi.org/10.1039/d4sm00309h
- DOI: https://doi.org/10.1103/physrevresearch.5.043148
- DOI: https://doi.org/10.1103/physrevlett.131.238402
- DOI: https://doi.org/10.1063/5.0150224
- DOI: https://doi.org/10.1103/physrevlett.130.058402
- DOI: https://doi.org/10.7554/elife.79901
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- DOI: https://doi.org/10.1063/5.0089166
- DOI: https://doi.org/10.1103/physrevlett.128.178101
- DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-031-06573-6_8
- DOI: https://doi.org/10.1103/physreve.104.025005
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkab275
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