Koki Tsuyuzaki 研究室
主宰者:Koki Tsuyuzaki
理化学研究所・RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、大規模で複雑な生物学的データから意味のあるパターンを抽出することを主な課題としています。単細胞RNA発現解析や脳全体の神経活動記録など、現代の生物学で生じる高次元データに対して、従来の解析手法では計算が追いつかない問題に直面しています。この課題に対し、行列分解やテンソル分解といった次元削減の手法を用いて、大規模データセットから潜在的な生物学的成分を効率的に抽出する方法を開発しています。
研究のもう一つの柱は、これらの計算手法を生物学的現象の理解に応用することです。海ウニ幼生の神経発生や細胞分化、線虫の脳全体の神経活動パターンの解析、ショウジョウバエのストレス応答など、様々な生物種・現象を対象として、単細胞レベルのデータから機能的な細胞集団や神経回路の役割を明らかにしています。さらに、ワクチンの副反応症状の時間的変化など、臨床医学的な応用も進めています。
これらの研究を支える基盤として、開発した計算手法をJulia言語やR言語のパッケージとして公開し、広く利用可能にしています。生物学の研究者が高度な統計知識なしに大規模データを解析できるツール整備を通じて、生物学全体の研究基盤を強化する取り組みも特徴的です。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果(18 件)
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- DOI: https://doi.org/10.1242/dev.205025
- DOI: https://doi.org/10.21105/joss.09293
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- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-025-65628-9
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-025-63111-z
- DOI: https://doi.org/10.21105/joss.05496
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.xpro.2023.102318
- DOI: https://doi.org/10.1186/s12859-023-05490-y
- DOI: https://doi.org/10.21105/joss.05664
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- DOI: https://doi.org/10.1186/s12859-023-05230-2
- DOI: https://doi.org/10.21105/joss.05015
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2022.105237
- DOI: https://doi.org/10.1111/age.13159
- DOI: https://doi.org/10.7490/f1000research.1118833.1
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