Ryota Yamagami 研究室
主宰者:Ryota Yamagami
愛媛大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室では、転移RNA(tRNA)の構造と機能、ならびにそこに含まれる化学修飾に焦点を当てた研究を展開しています。tRNAはタンパク質合成に必須の分子ですが、その立体構造や化学修飾が機能にどのように影響するかについて、多角的な解析を行っています。
主な研究の問いは以下の通りです:①tRNAの二次構造がどのように形成・維持されるのか、②tRNA修飾酵素がどのようなメカニズムで特定のtRNA分子を認識して修飾するのか、③化学修飾がRNA構造の安定性や機能にどのような役割を果たすのかという点です。
研究手法としては、化学プローブを用いた構造解析、次世代シーケンシング、精製タンパク質を用いた生化学実験、X線結晶構造解析、計算化学による設計支援など、多様なアプローチを組み合わせています。特に、高スループット分析技術を用いて数多くのtRNA変異体の機能を一括評価する方法論も開発しています。
これまでの研究により、tRNA修飾酵素が基質となるtRNAの特定の立体構造要素(ループ領域の位置や特定の塩基対など)を認識して修飾することが明らかにされています。また、天然の化学修飾がtRNAの構造安定性を高め、ストレス条件下やRNA-タンパク質混在環境でも機能を維持する上で重要であることが示されています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果(15 件)
- DOI: https://doi.org/10.1261/rna.081029.126
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkaf845
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jmb.2025.169328
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkaf579
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.biochi.2025.06.010
- DOI: https://doi.org/10.1261/rna.080405.125
- DOI: https://doi.org/10.3389/frnar.2024.1415530
- DOI: https://doi.org/10.1261/rna.079923.123
- DOI: https://doi.org/10.1093/jb/mvad076
- DOI: https://doi.org/10.1126/sciadv.adh5152
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- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2022.102759
- DOI: https://doi.org/10.1261/rna.079445.122
- DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.2201237119
- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms23074046
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.biochem.1c00012
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