Satoru Itoh 研究室
主宰者:Satoru Itoh
総合研究大学院大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、タンパク質の凝集現象の分子的メカニズムを計算シミュレーションにより解明する研究を展開しています。特にアルツハイマー病と関連するアミロイドベータペプチドの凝集・線維化過程を主な対象としており、細胞膜表面や空気と水の界面といった異なる環境下でのペプチドの構造変化と凝集促進機構を調べています。また、ポリフェノール類といった天然化合物や赤外光がこれらの凝集をどのように阻害するかについても計算化学的手法を用いて研究しており、治療法開発への応用を目指しています。
研究手法としては、分子動力学シミュレーションを中心に、複数の温度条件を組み合わせた高度なサンプリング手法を開発・活用しています。従来の計算では困難であった核生成から成熟まで、タンパク質凝集の全過程を追跡することが可能になりました。さらに、原子間力顕微鏡を用いた実験との組み合わせにより、ペプチド線維の成長過程を単分子レベルで観察し、計算結果を検証しています。
本研究室の主要な知見として、疎水性と親水性の性質を持つペプチドが界面に集中することが凝集を加速させることが複数の研究で示されています。また、特定のアミノ酸残基がペプチド間の相互作用に重要な役割を果たすこと、さらには水分子が凝集の形成と破壊の両過程に重要な役割を担うことが明らかになっています。これらの知見は、神経変性疾患の理解と治療戦略の開発に寄与する可能性があります。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果(28 件)
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- [2024] Nonequilibrium Molecular Dynamics Method to Generate Poiseuille-Like Flow between Lipid BilayersDOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.4c00750
- DOI: https://doi.org/10.2142/biophysico.bppb-v20.0045
- DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0291093
- DOI: https://doi.org/10.1021/acschemneuro.3c00192
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- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-022-14766-x
- DOI: https://doi.org/10.1002/jcc.27020
- DOI: https://doi.org/10.1021/acschemneuro.2c00358
- [2022] State-of-the-Art Molecular Dynamics Simulation Studies of RNA-Dependent RNA Polymerase of SARS-CoV-2DOI: https://doi.org/10.3390/ijms231810358
- DOI: https://doi.org/10.3390/molecules27082483
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.cpc.2022.108362
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.1c10788
- DOI: https://doi.org/10.1063/5.0089417
- DOI: https://doi.org/10.1063/5.0081686
- DOI: https://doi.org/10.2142/biophysico.bppb-v19.0010
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.cplett.2021.138819
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2021.e06102
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- DOI: https://doi.org/10.1038/s42003-021-01776-0
- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms22041859
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