Jun Ohnuki 研究室
主宰者：Jun Ohnuki
総合研究大学院大学
AI 要約（直近 5 年の研究成果）
本研究室は、細胞膜を横切ってイオンや物質を運ぶタンパク質、および化学反応を進める酵素タンパク質の動き方を計算機シミュレーションで調べています。特に、タンパク質がどのような形に変わることで機能するのかに着目しており、その過程を原子レベルの詳細さで解明することを目指しています。
研究手法として、分子動力学シミュレーション（原子の動きを時間を追いながら計算する方法）と、最新の人工知能型タンパク質構造予測ツール（AlphaFold）を組み合わせています。これにより、実験では観測しにくい中間状態の形や、タンパク質がどのような経路で形を変えるのかを明らかにすることができます。
これまでの研究で、病原性バクテリアのエネルギー生成に関わる酵素がナトリウムイオンを運ぶしくみ、腎臓結石の形成に関わるシュウ酸運搬タンパク質の立体構造変化、およびペプチド合成を行う酵素タンパク質における複数の反応ステップの機構などを報告しています。このアプローチは、医学応用や創薬ターゲット探索にも貢献する可能性があります。
※ AI（Claude）が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果（5 件）
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.6c00347
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.4c02726
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.3c03052
- [2023] Electrostatic Ratchet for Successive Peptide Synthesis in Nonribosomal Molecular Machine RimKDOI: https://doi.org/10.1021/jacs.3c03926
- DOI: https://doi.org/10.7566/jpsj.91.114602
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