Yasuhiro Matsunaga 研究室
主宰者:Yasuhiro Matsunaga
理化学研究所・RIKEN Center for Computational Science
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、タンパク質の構造と機能の関係を計算科学で解き明かす研究に取り組んでいます。特に、タンパク質が構造を変化させるプロセスや、イオンポンプなどの膜タンパク質による物質輸送の仕組みについて、原子レベルでの動きを追跡する分子動力学シミュレーション手法を用いて調べています。さらに、タンパク質の予測や構造特性の理解に向けて、機械学習モデルと従来の物理シミュレーションを組み合わせた新しいアプローチを展開しています。
現在の主要な研究テーマは二つの方向性があります。一つは、ナノボディ(小型の抗体)の熱安定性や構造特性の解析で、言語モデルを活用した予測手法や、AFM(原子間力顕微鏡)で観測された生体分子の形状から構造情報を推定する技術開発を行っています。もう一つは、タンパク質の複雑な構造変化を効率的にシミュレーションするための計算手法の開発で、複数の領域が協調して動く大規模なタンパク質の挙動や、エネルギー効率の良い反応経路を見つけ出す研究を進めています。これらの研究を通じて、タンパク質工学や医薬品開発に役立つ基礎知識を提供することを目指しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
外部リンク
関連研究室(8 件)
- 社会科学Shinichi Ookawara 研究室東京工業大学論文 100 件·共通: エネルギー, 古典物理, 力学, 基礎物理 +6
- 工学Hirokazu Sugiyama 研究室東京大学論文 102 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, 物理学 +7
- 工学Hidetoshi Takahashi 研究室慶應義塾大学論文 100 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, 物理学 +4
- 環境科学Ryozo Ooka 研究室東京大学論文 151 件·共通: エネルギー, 古典物理, 力学, 基礎物理 +3
- 医学Yoshitake Yamada 研究室Keio University Hospital論文 100 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, 物理学 +3
- 材料科学Yuji C. Sasaki 研究室東京大学論文 116 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, 物理学 +5
- 医学Kouhei Tsumoto 研究室東京大学論文 100 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, 物理学 +5
- 工学Weiwei Wan 研究室大阪大学論文 100 件·共通: 理論計算機科学, アルゴリズム, 計算機科学, 情報工学 +3
研究成果(30 件)
- DOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.19480005
- DOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.18012026
- [2026] 月面上であそぶ動くおもちゃものづくり教材の開発DOI: https://doi.org/10.14945/0002001936
- DOI: https://doi.org/10.2142/biophys.65.328
- [2025] 中学校「探究」における紙製マリオネット制作の授業実践DOI: https://doi.org/10.14945/0002001808
- DOI: https://doi.org/10.64898/2025.12.22.695878
- DOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.18012027
- DOI: https://doi.org/10.14945/0002001837
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.4c02096
- DOI: https://doi.org/10.1164/ajrccm-conference.2024.209.1_meetingabstracts.a1386
続きを表示(残り 20 件)閉じる
- [2024] ルーローの三角形を車輪に用いた偏心車輪模型の運動解析DOI: https://doi.org/10.14945/0002001086
- DOI: https://doi.org/10.14945/0002001110
- DOI: https://doi.org/10.1038/s42003-024-07218-x
- [2023] 現実事象と数学的抽象化を往還する数学的探究活動 "塩山"DOI: https://doi.org/10.14945/0002000153
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.3c01025
- DOI: https://doi.org/10.14945/0002000172
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-022-27057-2
- DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1010384
- [2022] 高校数学における塩山を用いた探究活動の授業実践DOI: https://doi.org/10.14945/00029263
- DOI: https://doi.org/10.14945/00029262
- [2022] 積層体を創る数学的ものづくり活動教材の開発DOI: https://doi.org/10.14945/00029245
- [2022] 機構部分に針金を使用したオートマタ教材の開発DOI: https://doi.org/10.14945/00028700
- DOI: https://doi.org/10.3390/antib11010010
- DOI: https://doi.org/10.2142/biophys.62.298
- [2022] 第60回年会予稿集DOI: https://doi.org/10.2142/biophys.62.s1
- DOI: https://doi.org/10.3390/life11121428
- DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.2105507118
- DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009215
- [2021] Coarse-Grained Modeling of Multiple Pathways in Conformational Transitions of Multi-Domain ProteinsDOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.1c00286
- DOI: https://doi.org/10.1063/5.0047730
科研費(0 件)
まだデータがありません(KAKEN 取り込み後に表示)。
所属学会・役職(0 件)
まだデータがありません(学会データ連携後に表示)。