Alok Sharma 研究室
主宰者:Alok Sharma
東京大学
兼任:理化学研究所・RIKEN Center for Integrative Medical Sciences
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
Alok Sharma研究室は、生物学的データの解析と予測を目的とした機械学習・深層学習の開発を中心に研究を行っています。研究室では、タンパク質の機能や構造に関する複雑なパターンを計算モデルで検出することに取り組んでいます。具体的には、タンパク質内における様々な化学修飾(リン酸化やメチル化など)が起きる位置の予測、タンパク質同士が相互作用する部位の同定、および単一細胞レベルでの遺伝子発現データから免疫細胞の種類を自動判定するなど、生物医学的に重要な問題に対して深層学習モデルを適用しています。
これらの研究では、タンパク質の1次配列情報や立体構造情報、進化的背景を反映した特徴量を組み合わせることで、予測精度を向上させています。さらに研究室は、遺伝子発現データや表形式のデータセットなど、異なる形式のバイオデータを複数の視点から表現し直すことで、機械学習モデルがより詳細な情報を捉えられるよう工夫しています。これらの計算手法は、実験的に得ることが困難で時間と費用がかかる生物学的情報を迅速かつ安価に予測することを可能にし、医療応用や創薬研究への貢献を目指しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
外部リンク
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- DOI: https://doi.org/10.1093/bib/bbab297
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