T. Arakawa 研究室
主宰者:T. Arakawa
東京大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
**研究の問い**
この研究室は、微生物が持つ様々な糖質分解酵素の構造と機能の解明に取り組んでいます。特に、細菌や真菌が産生する酵素がどのようにして複雑な糖鎖構造を認識し、切断するのかという問題に焦点を当てています。また、これらの酵素がどのような反応メカニズムで基質に作用するのか、さらには未知の酵素機能を持つ新規酵素の発見と分類も重要な研究対象です。
**手法**
研究室では、X線結晶構造解析を基盤とした構造生物学的アプローチを中心に展開しています。単結晶の成長・解析に加えて、中性子結晶学を組み合わせることで、酵素内の水素原子を含む詳細な構造情報を得ています。並行して、酵素の遺伝子クローニング、発現・精製、生化学的活性測定、部位特異的変異導入など、古典的な分子生物学・生化学的手法も駆使しています。さらに阻害剤を利用した活性部位の同定や、基質複合体構造の観察を通じて、反応メカニズムの詳細を推定しています。
**主要な発見**
複数の研究から、亜鉛を含む独特の活性部位構造を持つ酵素や、従来の分類には当てはまらない新規な触媒メカニズムの存在が明らかになっています。特に、結晶構造と生化学データの組み合わせにより、基質認識と触媒反応の詳細な機構が段階的に解き明かされており、これまで未同定だった酵素機能の発見へとつながっています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
外部リンク
関連研究室(8 件)
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研究成果(21 件)
- DOI: https://doi.org/10.1128/spectrum.00235-26
- DOI: https://doi.org/10.5458/jag.jag.jag-2024_0005
- DOI: https://doi.org/10.5458/jag.jag.jag-2024_0005
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2024.105774
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.str.2024.02.012
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2024.105774
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-023-41431-2
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2023.105508
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2023.105508
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-023-41431-2
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- DOI: https://doi.org/10.1111/febs.15795
- DOI: https://doi.org/10.1002/anie.202013920
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2021.101324
- DOI: https://doi.org/10.1093/glycob/cwab103
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2021.101001
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2021.101324
- DOI: https://doi.org/10.1093/glycob/cwab103
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2021.101001
- DOI: https://doi.org/10.1111/febs.15795
- DOI: https://doi.org/10.1002/anie.202013920
- DOI: https://doi.org/10.1002/ange.202013920
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