Yasushi Ishihama 研究室
主宰者：Yasushi Ishihama
京都大学
AI 要約（直近 5 年の研究成果）
本研究室は、質量分析計を用いた蛋白質解析技術の開発と応用を中心に展開しています。特に液体クロマトグラフィーと質量分析の組み合わせにより、細胞や組織に含まれる数千種類の蛋白質を網羅的に同定・定量する「プロテオミクス」の方法論を研究しています。新しい蛋白質分解酵素の活用、ペプチドの溶解性向上、試料精製技術の改良など、分析の感度と網羅性を高めるための基盤技術開発に取り組んでいます。
蛋白質の翻訳後修飾、特にリン酸化による機能調節や、疾患関連の遺伝子変異が蛋白質間相互作用に及ぼす影響の解析も進めています。また、蛋白質の立体構造変化を化学的にプローブして検出する手法や、蛋白質の末端領域を網羅的に解析する方法の開発により、蛋白質の多様な機能制御機構を明らかにしようとしています。
さらに、大規模プロテオミクスデータの国際的な共有と再解析を推進する取り組みにも力を入れており、公開データベースの整備や新しい評価基準の提案を通じて、プロテオミクス研究の効率化と信頼性の向上に貢献しています。
※ AI（Claude）が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果（85 件）
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- DOI: https://doi.org/10.1038/s41594-025-01647-w
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.mcpro.2025.101019
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.5c01385
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- DOI: https://doi.org/10.1038/s42004-025-01540-z
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.5c00011
- DOI: https://doi.org/10.5702/massspec.24-009
- DOI: https://doi.org/10.1021/acsmeasuresciau.4c00089
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- DOI: https://doi.org/10.1039/d5tb00170f
- DOI: https://doi.org/10.1002/pmic.202400394
- DOI: https://doi.org/10.1039/d4cc04452e
- DOI: https://doi.org/10.5702/massspectrometry.k0013
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- [2024] Retention time prediction for post-translationally modified peptides: Ser, Thr, Tyr-phosphorylationDOI: https://doi.org/10.1016/j.chroma.2024.464714
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.nanolett.4c03293
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2024.108136
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.4c03753
- DOI: https://doi.org/10.5702/massspec.24-002
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- DOI: https://doi.org/10.5702/massspectrometry.a0152
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.mcpro.2024.100820
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-024-48615-4
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.aca.2024.342755
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-024-07526-6
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.03.030
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.mcpro.2023.100627
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.3c02527
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.mcpro.2023.100677
- DOI: https://doi.org/10.1261/rna.079633.123
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.3c01015
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.3c03411
- DOI: https://doi.org/10.1111/gtc.13063
- DOI: https://doi.org/10.5702/massspec.s23-30
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-023-39347-y
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.3c01311
- DOI: https://doi.org/10.1111/jre.13140
- DOI: https://doi.org/10.1186/s13075-023-03057-z
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.mcpro.2023.100535
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2022.102865
- DOI: https://doi.org/10.1126/scisignal.abm5011
- DOI: https://doi.org/10.15583/jpchrom.2022.016
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-022-33363-0
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2022.104516
- [2022] Gone with the Corona?DOI: https://doi.org/10.5702/massspec.s22-32
- DOI: https://doi.org/10.3390/cancers15010078
- DOI: https://doi.org/10.1093/hmg/ddac064
- DOI: https://doi.org/10.1002/1873-3468.14323
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.crmeth.2021.100138
- DOI: https://doi.org/10.1039/d1na00865j
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.2c04391
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.2c00388
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.mcpro.2022.100436
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkac1040
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.chroma.2022.463645
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.stemcr.2022.10.012
- DOI: https://doi.org/10.1002/stem.3359
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.0c00819
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- [2021] A protocol for analyzing the protein terminome of human cancer cell line culture supernatantsDOI: https://doi.org/10.1016/j.xpro.2021.100682
- DOI: https://doi.org/10.1186/s13059-020-02240-8
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2021.100673
- DOI: https://doi.org/10.1007/978-1-0716-1178-4_20
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.mcpro.2021.100119
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- DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2021.102839
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.1c03722
- DOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.5750874
- DOI: https://doi.org/10.1126/sciadv.abj6895
- DOI: https://doi.org/10.3389/fcell.2021.762293
- DOI: https://doi.org/10.1002/pmic.202100144
- DOI: https://doi.org/10.7554/elife.71966
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-021-99556-7
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-021-97868-2
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.1c00444
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.1c00185
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkab549
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2021.05.077
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