Takeru Kameda 研究室
主宰者:Takeru Kameda
広島大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、RNA・DNA・クロマチンといった生体分子の構造と機能の関係を計算機シミュレーションを用いて解明する研究を行っています。特に、遺伝子発現の初期段階であるタンパク質翻訳の開始過程に注目し、リボソームが正確に開始コドンを認識する仕組みをコンピュータで再現・分析しています。翻訳開始において、標準的なAUGコドンだけでなく、GUGやCUGといった非標準的なコドンがどのように認識されるのか、その際にRNA塩基の化学修飾がどう影響するのかを調べています。
分子動力学シミュレーション技術を用いて、コドンと対応する反対鎖(アンチコドン)がどのように相互作用するか、エネルギー的な視点から詳細に追跡しています。計算結果を実験結果と組み合わせることで、原子レベルでの相互作用メカニズムを明らかにしています。加えて、DNA甲基化やクロマチンの圧縮状態といった、遺伝子発現に関わるより大きなスケールの構造変化についても、同様の計算手法を適用して調査しています。これらの研究を通じて、遺伝子がどのように選別的に使い分けられるのかを理解することを目指しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
外部リンク
関連研究室(8 件)
- 心理学Naomichi Ogihara 研究室University of Tokyo Hospital論文 100 件·共通: エネルギー, 古典物理, 力学, 基礎物理 +4
- 医学Haruki Kume 研究室東京大学論文 100 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, 物理学 +6
- 環境科学Ryozo Ooka 研究室東京大学論文 151 件·共通: エネルギー, 古典物理, 力学, 基礎物理 +3
- 材料科学Yuji C. Sasaki 研究室東京大学論文 116 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, 物理学 +5
- 工学Hirokazu Sugiyama 研究室東京大学論文 102 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, 物理学 +4
- 環境科学Hideki Kikumoto 研究室東京大学論文 169 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, 物理学 +1
- 医学Masaki Kobayashi 研究室東京工業大学論文 100 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, 物理学 +1
- 医学Noriaki Ichihashi 研究室京都大学論文 100 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, 物理学
研究成果(6 件)
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.xpro.2024.103223
- DOI: https://doi.org/10.1126/sciadv.abm8501
- DOI: https://doi.org/10.2142/biophysico.bppb-v19.0027
- [2021] Local states of chromatin compaction at transcription start sites control transcription levelsDOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkab587
- DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009068
- DOI: https://doi.org/10.1103/physreve.103.012404
科研費(0 件)
まだデータがありません(KAKEN 取り込み後に表示)。
所属学会・役職(0 件)
まだデータがありません(学会データ連携後に表示)。