Chie Motono 研究室
主宰者:Chie Motono
早稲田大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
Motono研究室は、タンパク質の構造と動的な挙動を計算機シミュレーションと機械学習を組み合わせて解析する研究を展開しています。特に、タンパク質が通常は隠れている結合部位(クリプティックサイト)がどのように出現し、機能するのかを明らかにすることに注力しており、創薬ターゲットの探索に応用しています。複数の化学的性質が異なる分子を用いた分子動力学シミュレーションと位相データ解析や機械学習手法を統合したアプローチにより、従来は発見が困難だった潜在的な結合部位を予測する方法を開発しています。
同時に、個々のタンパク質分子の機能メカニズムの解明にも注力しています。パーキンソン病の原因遺伝子であるDJ-1タンパク質について、その触媒活性や細胞内局在化の仕組みを生化学実験とシミュレーション解析の両面から調査しています。また、細胞内の自動分解に関わる酵素Atg15の活性化機構や、遺伝子発現の効率を向上させるペプチドの同定と予測にも取り組んでいます。さらに研究室は、単一細胞レベルでの染色体立体構造の再構築や、医薬品による細胞内シグナル伝達の変化を網羅的に測定・データベース化する試みなど、多様なバイオインフォマティクス手法の開発も進めています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果(10 件)
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- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.4c02111
- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms26104710
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2024.107476
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2023.113567
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41594-022-00897-2
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-022-15038-4
- [2022] Phosprof: pathway analysis database of drug response based on phosphorylation activity measurementsDOI: https://doi.org/10.1093/database/baac072
- DOI: https://doi.org/10.1242/jcs.258653
- DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btab538
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