Yoshihiko Tomofuji 研究室
主宰者：Yoshihiko Tomofuji
大阪大学
兼任：理化学研究所・RIKEN Center for Integrative Medical Sciences
AI 要約（直近 5 年の研究成果）
本研究室は、遺伝子と環境因子の相互作用が、個人差のある病気や体質の発症にいかに影響するかを明らかにする研究に取り組んでいます。特に、腸内細菌（マイクロバイオーム）と宿主の遺伝情報の相互作用に焦点を当て、自己免疫疾患や炎症性腸疾患などの発症メカニズムを解明しようとしています。複数の民族集団を対象とした大規模なゲノム解析データと、高精度な遺伝子発現解析技術を組み合わせることで、病気と微生物叢の関連性を体系的に調べています。
研究手法としては、ショットガンシーケンシングと呼ばれる次世代シーケンス技術を用いた腸内微生物のDNA解析、単一細胞レベルでの免疫細胞の遺伝子発現の測定、ゲノムワイド関連解析（GWAS）などを採用しています。これらの多層的なオミクスデータを統合することで、特定の遺伝子変異を持つ個人で、特定の腸内細菌が増加しやすいといった関連性を発見しています。これまでの研究から、腸内細菌が産生する物質を介して宿主の免疫細胞が活性化し、その過程に関連する遺伝子が病気の発症リスクに影響することが明らかになってきました。
※ AI（Claude）が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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関連研究室(8 件)
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研究成果（21 件）
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- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-025-56077-5
- [2025] Deciphering state-dependent immune features from multi-layer omics data at single-cell resolutionDOI: https://doi.org/10.1038/s41588-025-02266-3
- DOI: https://doi.org/10.1126/sciimmunol.adm6843
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.02.017
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41588-024-02019-8
- DOI: https://doi.org/10.1097/01.ju.0001008740.27639.cc.19
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- [2023] Reconstruction of the personal information from human genome reads in gut metagenome sequencing dataDOI: https://doi.org/10.1038/s41564-023-01381-3
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41588-023-01375-1
- DOI: https://doi.org/10.1038/s43856-022-00231-3
- DOI: https://doi.org/10.1254/jpssuppl.97.0_1-b-s05-2
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2023.113324
- DOI: https://doi.org/10.1093/rheumatology/keac528
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41590-022-01285-0
- DOI: https://doi.org/10.1093/nargab/lqac019
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.xgen.2022.100219
- [2021] Whole gut virome analysis of 476 Japanese revealed a link between phage and autoimmune diseaseDOI: https://doi.org/10.1136/annrheumdis-2021-221267
- DOI: https://doi.org/10.1136/annrheumdis-2021-220687
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