Ryuichiro Ishitani 研究室
主宰者:Ryuichiro Ishitani
東京都医学総合研究所
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
Ishitani研究室は、計算化学と機械学習を駆使してタンパク質や化学物質の構造と機能を解明する研究を行っています。タンパク質の設計では、AIを用いて目標構造を保ちながら配列の多様性を高める方法や、タンパク質が形を変える過程を系統的に予測する手法を開発しています。また、医薬品開発に向けて、小分子がタンパク質に結合する部位の予測やタンパク質-化学物質の相互作用を推定するモデルを構築しており、これらの手法はアルファフォールドなどの最新の深層学習技術を基盤としています。
同時に、細胞膜に存在するGタンパク質共役受容体の構造解析にも取り組んでいます。骨代謝に関わるホルモン受容体やリン脂質受容体について、cryo-EM(冷凍電子顕微鏡)や分子動力学シミュレーションを用いて、リガンド結合時の構造変化や信号伝達の仕組みを調べています。さらに、光制御されるイオンチャネルの光応答メカニズムを時間分解結晶構造解析で明らかにするなど、様々なスケールでのタンパク質機能解析を展開しています。また計算材料科学の分野では、多元素対応の汎用的なニューラルネットワーク势を開発し、新規材料の探索にも応用しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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関連研究室(8 件)
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研究成果(17 件)
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- DOI: https://doi.org/10.1021/acsomega.5c07675
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41589-025-01957-6
- [2025] The reaction mechanism for glycolysis side product degradation by Parkinson’s disease–linked DJ-1DOI: https://doi.org/10.1083/jcb.202411078
- DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0308425
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- DOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.6984632
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.2c00366
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-022-30687-9
- DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0263296
- DOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.5533040
- DOI: https://doi.org/10.2142/biophys.62.367
- DOI: https://doi.org/10.7554/elife.62389
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