Zichang Xu 研究室
主宰者:Zichang Xu
大阪大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、免疫応答を分子レベルで解析し、疾患の検出・理解に応用する研究を行っています。特に、感染症やがん、自己免疫疾患の診断において、血液中の免疫細胞が持つ受容体の多様性や特性に着目しています。新型コロナウイルス感染者の抗体レパートリーを詳しく調べることで、自己抗体の産生機序や感染増強抗体の分布パターンを明らかにしてきました。これらの知見に基づき、循環免疫細胞の受容体配列データから疾患の有無を判定する機械学習モデルの開発も進めています。
同時に、抗体と抗原の相互作用を予測する計算手法の構築に取り組んでいます。抗体の相補性決定領域(CDRと呼ばれる特異性を決める領域)の塩基配列から抗体の標的抗原を推定したり、配列情報から三次元立体構造をモデル化し、結合様式をシミュレーションする技術を開発しています。最先端のタンパク質構造予測手法を組み合わせることで、予測精度の向上を実現しています。
さらに、医療画像の自動解析分野でも、ニューラルネットワークに注意機構とトランスフォーマーを統合した深層学習モデルの開発を行っており、疾患の定量化と治療評価を支援する基盤技術の構築を進めています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果(9 件)
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- DOI: https://doi.org/10.3389/fbioe.2024.1398237
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- DOI: https://doi.org/10.1128/msystems.00722-23
- [2022] AbAdapt: an adaptive approach to predicting antibody–antigen complex structures from sequenceDOI: https://doi.org/10.1093/bioadv/vbac015
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.csbj.2022.11.001
- DOI: https://doi.org/10.1007/s12551-022-01031-8
- DOI: https://doi.org/10.1007/978-1-0716-2609-2_15
- DOI: https://doi.org/10.1002/cbic.202200303
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