Piero Carninci 研究室
主宰者：Piero Carninci
理化学研究所・RIKEN Center for Integrative Medical Sciences
AI 要約（直近 5 年の研究成果）
本研究室は、細胞が持つ遺伝子情報の読み出し機構をゲノム規模で解明することを中心に研究を進めています。具体的には、DNA配列から遺伝子産物がどのように作られるか、その過程で多様な転写産物がいかにして生じるかを調べています。これらの研究は、単一細胞ごとの遺伝子発現解析や、染色体3次元構造データの統合的な解析により、従来の方法では見落とされていた遺伝子調節機構を明らかにしています。
手法としては、長読み配列解析技術、CAGEと呼ばれる転写開始部位の検出法、そしてRNA-DNAの相互作用を網羅的に調べる手法など、複数の先進的な実験技術を組み合わせています。さらに、これらのデータを統合し、機械学習を用いた解析ツールの開発も行っており、膨大なゲノムデータから生物学的に意味のある情報を抽出する基盤作りに取り組んでいます。
研究の対象は、免疫細胞から脳組織、筋骨格系など多岐にわたり、健常者の複数集団を含む大規模なアトラスの構築も進めています。こうした研究成果は公開データベースとして整備され、医学応用や疾患メカニズムの理解につながるプラットフォームが提供されています。
※ AI（Claude）が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果（55 件）
- DOI: https://doi.org/10.64898/2026.02.01.703142
- DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0339624
- DOI: https://doi.org/10.1186/s12915-026-02580-0
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41422-026-01248-2
- [2026] Co-regulatory changes in <i>Homo sapiens</i> prefrontal cortex shape RNA-chromatin interactionsDOI: https://doi.org/10.64898/2026.03.14.711601
- DOI: https://doi.org/10.1186/s13059-026-04002-4
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.02.017
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkaf788
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.xpro.2024.103594
- DOI: https://doi.org/10.64898/2025.12.15.694370
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- DOI: https://doi.org/10.1093/jbmrpl/ziaf178
- DOI: https://doi.org/10.1002/alz.70852
- DOI: https://doi.org/10.1186/s40246-025-00804-y
- [2024] Systematic assessment of long-read RNA-seq methods for transcript identification and quantificationDOI: https://doi.org/10.1038/s41592-024-02298-3
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-024-45517-3
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2024.115020
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkae1047
- DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkae1054
- DOI: https://doi.org/10.1186/s12915-024-02032-7
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41525-024-00429-5
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.dnarep.2024.103737
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.xgen.2024.100625
- DOI: https://doi.org/10.1126/science.add8394
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-024-49523-3
- DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0295971
- DOI: https://doi.org/10.1182/blood-2023-185268
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.xpro.2022.102027
- DOI: https://doi.org/10.1002/ctm2.1226
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-023-06466-x
- DOI: https://doi.org/10.1093/nargab/lqad075
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.omtn.2023.04.002
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- DOI: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2022.111893
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41551-022-00961-8
- DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btac644
- DOI: https://doi.org/10.1126/sciadv.abo3192
- DOI: https://doi.org/10.1101/gr.276647.122
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.06.032
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41588-022-01089-w
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.omtn.2022.01.021
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.stemcr.2021.12.008
- DOI: https://doi.org/10.1101/gr.275354.121
- DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3001419
- DOI: https://doi.org/10.1186/s12863-021-00992-1
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-23143-7
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-23542-w
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jid.2021.02.172
- [2021] Antisense RNAs during early vertebrate development are divided in groups with distinct featuresDOI: https://doi.org/10.1101/gr.262964.120
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.stemcr.2021.02.006
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-21217-0
- DOI: https://doi.org/10.1007/978-1-0716-1597-3_4
- DOI: https://doi.org/10.1007/978-1-0716-1597-3_11
- DOI: https://doi.org/10.2139/ssrn.3933296
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