Yusuke Ogata 研究室
主宰者:Yusuke Ogata
理化学研究所・RIKEN Center for Integrative Medical Sciences
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、微生物のゲノム解析と微生物叢(マイクロバイオーム)の構造変化を通じて、環境と疾患における微生物群集の役割を明らかにすることを目指しています。淡水域に生息する細菌株の完全ゲノム配列を多数決定し、その遺伝特性を詳細に記述することで、環境適応機構の理解を進めています。同時に、ヒトの腸内および口腔内の微生物組成の変化を調査し、疾患発症との関連性を探求しています。
特に注力している研究テーマは、ヒト微生物叢と健康・疾患の関係です。遺伝子変動がヒトの腸内微生物組成に与える影響、医薬品(特に神経変性疾患の治療薬)が微生物群集に及ぼす効果、食事栄養因子と疾患感受性の関連性などを分析しています。さらに、大腸がん・多発性硬化症・急性虫垂炎・アレルギー性鼻炎といった複数の疾患において、特定の細菌株や微生物遺伝子が疾患進行と関連していることを報告しています。
研究手法としては、ショットガンメタゲノム解析や16S リボソーム RNA 遺伝子配列解析に加え、全ゲノム関連解析(GWAS)などの統計学的手法を組み合わせています。また、低バイオマス試料からの微生物 DNA 回収法の開発など、方法論的な改善にも取り組み、微生物研究の精度向上に貢献しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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研究成果(28 件)
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- DOI: https://doi.org/10.1099/ijsem.0.007060
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.clnesp.2026.102918
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.reth.2025.10.019
- DOI: https://doi.org/10.1128/mra.00944-25
- DOI: https://doi.org/10.3389/frmbi.2025.1635907
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jiac.2025.102761
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2025.112593
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2024.114785
- [2024] Dimension reduction of microbiome data linked Bifidobacterium and Prevotella to allergic rhinitisDOI: https://doi.org/10.1038/s41598-024-57934-x
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- DOI: https://doi.org/10.1128/mra.00784-23
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-023-46890-7
- DOI: https://doi.org/10.1128/spectrum.05123-22
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jmii.2023.03.006
- DOI: https://doi.org/10.1128/mra.00030-23
- DOI: https://doi.org/10.1128/mra.01296-22
- DOI: https://doi.org/10.1128/mra.01247-22
- DOI: https://doi.org/10.1128/mra.01234-22
- DOI: https://doi.org/10.1128/mra.01122-22
- DOI: https://doi.org/10.1128/mra.00882-22
- [2022] Complete Genome Sequence of <i>Aquiluna</i> sp. Strain KACHI24, Isolated from River Surface WaterDOI: https://doi.org/10.1128/mra.00858-22
- DOI: https://doi.org/10.1128/mra.00176-22
- DOI: https://doi.org/10.1099/ijsem.0.005307
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-022-07398-8
- DOI: https://doi.org/10.1128/mra.00282-21
- DOI: https://doi.org/10.1128/mra.01474-20
- DOI: https://doi.org/10.1128/mra.01284-20
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