Masato Tokuhisa 研究室

本研究室は、細胞内の遺伝子どうしの相互作用ネットワークを解明することを目標としています。特に単一細胞レベルで測定された遺伝子発現データから、どの遺伝子がどの遺伝子の活動を制御しているかといった規制関係を推定する手法の開発に取り組んでいます。従来の方法の多くは時系列データの時間微分を利用していますが、単一細胞データでは測定時刻の情報が不正確であるため、このアプローチが機能しにくいという課題に直面していました。 この課題を克服するため、本研究室では機械学習の一種であるランダムフォレストという手法に着目し、改良を重ねています。遺伝子発現の時間的な変化を直接的に計算する代わりに、変化の方向性（増加または減少）といった情報を活用する手法を開発しました。さらに、複数のランダムフォレストから得られた結果を比較・統合する際の課題を解決するため、遺伝子の重要度を評価する新たな指標も提案しています。これらの改良により、より正確かつ堅牢な遺伝子ネットワーク推定が可能になることを目指しています。