Duy Phuoc Tran 研究室
主宰者:Duy Phuoc Tran
東京工業大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
本研究室は、タンパク質の構造と機能の関係を解明することを主な目標としています。特に、神経伝達物質の受容体など、細胞膜に存在するタンパク質(G タンパク質共役型受容体)がどのように信号を伝えるのかを調べています。研究の問いは、これらの受容体がどのような構造変化を通じて活性化し、また病的な変異がどのように機能障害をもたらすのか、という点に集約されます。
研究手法としては、計算化学の手法を中心に展開しており、特に分子動力学シミュレーション(MD)と呼ばれるコンピュータ解析が多用されています。並列カスケード選択分子動力学法(PaCS-MD)やマルコフ状態モデルなどの革新的なシミュレーション技術を開発・応用し、タンパク質が取りうる様々な立体構造を詳細に探索します。同時に、生化学的実験手法も組み合わせており、細胞を使った受容体機能の測定や、試験管内での進化実験を通じてシミュレーション結果を検証しています。
主要な発見として、受容体内部の保存されたイオン結合部位や疎水性アミノ酸のネットワークが、受容体の活性化に普遍的な役割を果たしていることが明らかになっています。また、疾病の原因となる受容体の変異について、機能不全の分子的メカニズムを詳細に解析し、その知見を薬剤開発に応用できる可能性を示しています。これらの成果は、遺伝性疾患の理解と治療法開発に貢献しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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関連研究室(8 件)
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研究成果(40 件)
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- [2026] DRD1-driven infantile dystonia: towards a mechanism-informed framework for GPCR receptoropathiesDOI: https://doi.org/10.1093/brain/awag128
- DOI: https://doi.org/10.1021/jacs.6c02372
- DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.2525502123
- DOI: https://doi.org/10.64898/2026.02.23.707339
- DOI: https://doi.org/10.1007/s43939-025-00496-0
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.5c01755
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- [2025] In vitro evolution of adenosine A2A receptor based on an antagonist binding using ribosome displayDOI: https://doi.org/10.26434/chemrxiv-2025-jnkvw
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.abb.2025.110518
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41589-024-01682-6
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.4c01271
- DOI: https://doi.org/10.1039/d2bm01759h
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2022.09.072
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-022-07792-2
- DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-021-90245-z
- [2021] Delineating the conformational landscape of the adenosine A2A receptor during G protein couplingDOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.02.041
- DOI: https://doi.org/10.2142/biophysico.bppb-v18.037
- DOI: https://doi.org/10.2142/biophys.61.398
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