Akifumi Oda 研究室
主宰者：Akifumi Oda
大阪大学
AI 要約（直近 5 年の研究成果）
本研究室は、主として計算化学・分子動力学シミュレーションの手法を用いて、タンパク質と小分子の相互作用メカニズムおよび加齢に伴うタンパク質変化の現象解明に取り組んでいます。具体的には、医薬品代謝酵素（チトクロムP450など）の機能変動、抗ウイルス薬耐性の獲得メカニズム、アルツハイマー病関連のアミロイドβペプチドの構造変化などを研究対象としています。
医薬品代謝に関しては、遺伝子多型により引き起こされる酵素活性の個人差を、細胞実験による機能評価と構造解析を組み合わせて調査しています。SARS-CoV-2やインフルエンザウイルスなどの病原体タンパク質については、アミノ酸置換がもたらす薬剤耐性化の予測を行っています。一方、生体内で加齢とともに進行するアスパラギン酸やアスパラギン残基の修飾反応（異性化や脱アミド化など）も量子化学計算を用いて検討し、タンパク質の凝集や不溶化との関連性を明らかにしています。さらに、原始地球での化学進化における初期タンパク質の成立機構についても、限定的なアミノ酸組成をもつペプチドの構造シミュレーションを通じて探究しています。
※ AI（Claude）が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
外部リンク
関連研究室(8 件)
- 生化学・分子生物学・遺伝学Keisuke Saito 研究室東京大学論文 100 件·共通: 量子化学, 理論・分光, 古典物理, 力学 +8
- 材料科学Yuji C. Sasaki 研究室東京大学論文 116 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, ウイルス +8
- 生化学・分子生物学・遺伝学Yasuteru Shigeta 研究室筑波大学論文 100 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, 酵素 +7
- 医学Motoko Yanagita 研究室Kyoto University Hospital論文 100 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, 物理学 +7
- 社会科学Takeshi Serizawa 研究室東京工業大学論文 100 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, 酵素 +6
- 物理学・天文学Masaaki Fujii 研究室東京工業大学論文 100 件·共通: 量子化学, 理論・分光, 物理化学, 物理学 +5
- 医学Kouhei Tsumoto 研究室東京大学論文 100 件·共通: 古典物理, 力学, 基礎物理, 物理学 +6
- 社会科学Katsunori Tanaka 研究室東京工業大学論文 100 件·共通: 構造化学・結晶学, 構造解析, 酵素, 微生物 +7
研究成果（34 件）
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.dmpk.2026.101539
- DOI: https://doi.org/10.1248/bpb.b26-00029
- DOI: https://doi.org/10.1093/chemle/upag015
- DOI: https://doi.org/10.1093/bulcsj/uoag005
- DOI: https://doi.org/10.1007/s00044-025-03499-x
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bcp.2025.117396
- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms26146819
- DOI: https://doi.org/10.1002/cbic.202500171
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpca.4c07299
- [2025] Molecular dynamics simulations of putative primitive proteins including β-aspartic acid residuesDOI: https://doi.org/10.1093/bulcsj/uoae143
続きを表示（残り 24 件）閉じる
- [2024] Functional significance of CYP2B6 gene rare allelic variants identified in Japanese individualsDOI: https://doi.org/10.1016/j.bcp.2024.116515
- DOI: https://doi.org/10.1248/bpb.b24-00031
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.4c01231
- DOI: https://doi.org/10.1248/bpb.b23-00908
- DOI: https://doi.org/10.1093/chemle/upae018
- DOI: https://doi.org/10.1124/dmd.123.001389
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.biochem.3c00097
- [2023] Effect of the Addition of the Fifth Amino Acid to [GADV]-Protein on the Three-Dimensional StructureDOI: https://doi.org/10.3390/life13010246
- DOI: https://doi.org/10.1124/dmd.122.001045
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jmgm.2022.108288
- DOI: https://doi.org/10.1021/acsomega.2c00372
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.comptc.2022.113605
- DOI: https://doi.org/10.3390/appliedchem1020011
- DOI: https://doi.org/10.1021/acsomega.1c04821
- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms221810119
- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms22189837
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.cplett.2021.139022
- DOI: https://doi.org/10.3390/jpm11080690
- DOI: https://doi.org/10.1248/bpb.b21-00083
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2021.113578
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.0c10194
- DOI: https://doi.org/10.3390/jpm11020094
- DOI: https://doi.org/10.3390/ijms22020509
科研費（0 件）
まだデータがありません（KAKEN 取り込み後に表示）。
所属学会・役職（0 件）
まだデータがありません（学会データ連携後に表示）。