Takashi Yoshidome 研究室
主宰者:Takashi Yoshidome
東北大学
AI 要約(直近 5 年の研究成果)
吉留研究室は、タンパク質や液体などの分子系における構造と物性の関係を計算機科学を用いて解明する研究を行っています。特に、タンパク質周辺の水和構造(タンパク質を取り巻く水分子の分布)が、タンパク質の折りたたみや分子間相互作用といった生物学的プロセスに果たす役割に着目しており、分子動力学シミュレーションや積分方程式理論といった理論計算手法を駆使して、その局在的な熱力学量を予測・評価しています。
近年の取り組みとして、機械学習技術の導入により計算効率を大幅に改善しています。深層学習モデルを用いてタンパク質周辺の水和構造を高速に予測するツールを開発し、従来は計算に数時間から数十時間を要した解析を数分程度で実施可能にしました。また、多様体学習という手法を活用して、実験データや構造データから本質的な分子情報を効率的に抽出する研究も展開しています。これらの手法を、電子顕微鏡実験データの解析やタンパク質モーター分子の動作機構の理解といった具体的な生物物理学的課題に応用することで、分子レベルでの生命現象の解明を目指しています。
※ AI(Claude)が、公開されている論文要旨から研究の問い・手法・主要な発見を事実情報として抽出・再構成して自動生成しています。誤りを含む可能性があるため、正確性は研究室公式情報でご確認ください。
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関連研究室(8 件)
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研究成果(17 件)
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.6c01684
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.jpowsour.2026.239916
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.5c02389
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.cplett.2025.142372
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.physa.2024.130201
- [2024] Extraction of molecular information from experimental data on liquids using manifold learningDOI: https://doi.org/10.1016/j.molliq.2024.126251
- DOI: https://doi.org/10.1002/chem.202300488
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2022.11.928
- DOI: https://doi.org/10.1002/jcc.27290
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.molliq.2023.123346
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- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2022.11.926
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2021.11.2047
- DOI: https://doi.org/10.7566/jpsj.91.094802
- DOI: https://doi.org/10.7566/jpsj.91.064804
- DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.2c00987
- DOI: https://doi.org/10.2142/biophysico.bppb-v18.011
- DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2020.11.716
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